Transcript GCDkit - cas.cz

Menu
Plot
Plots
Uživatelem definované grafické výstupy
•
Všem grafům je předřazena společná sada
dialogových oken pro výběr vzorků
•
Vykreslí se projekce těch vzorků, pro které jsou k
disposici příslušná data (odfiltrují se analýzy s
chybějícími daty)
•
Většinu grafů lze dále editovat pomocí menu Plot
editing
•
Grafy se otevírají v samostatných oknech, která lze
uložit v podobě souboru
Plots
Plots
(Calculations | CIPW  Calculations | Append results to data  Plots | Ternary)
Plots: 3D plot
Grafem lze rotovat zadáním úhlu
otočení kolem jednotlivých os
Plots: xyz plot with circles
V binárním grafu je třetí proměnná vyjádřená velikostí/barvou bodů
Plots
Sada grafů závislosti jedné proměnné na dalších (obojí lze definovat libovolně
z dostupných dat) (Harkerovy diagramy ap.)
Plots
Vykreslí sérii binárních
diagramů v závislosti na
hodnotě třetí proměnné rozčleněné do intervalů (Coplot) nebo podle skupin
(Coplot by group)
Plots
Spidergramy podle pořadí a
normalizačních hodnot různých autorů
Vlastní sestavu prvků lze definovat v
souboru GCDkit\spider.data
Citace předdefinovaných hodnot - viz
nápověda k funkci select.norm
Normalizovat lze i vybraným vzorkem (SAMPLE) nebo průměrem
(MEAN OF (SPECIFIED) SAMPLES)
Plots
•MORB (Pearce 1983)
–Sr, K, Rb, Ba, Th, Ta, Nb, Ce, P, Zr, Hf, Sm, Ti, Y, Yb
•NMORB (Sun & McDonough 1989)
–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•EMORB (Sun & McDonough 1989)
–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•PrimitiveMantle (Sun & McDonough 1989)
–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•OIB(Sun & McDonough 1989)
–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•REE chondrite (Boynton 1984)
–La, Ce, Pr, Nd, Pm, Sm, Eu, Gd, Tb, Dy, Ho, Er, Tm, Yb, Lu
•ORG (Pearce et al.1984)
–K2O, Rb, Ba, Th, Ta, Nb, Ce, Hf, Zr, Sm, Y, Yb
•Chondrite (Thompson 1982)
–Ba, Rb, Th, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Sm, Zr, Hf, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Upper crust (Taylor & McLennan 1985)
–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Lower crust (Weaver & Tarney 1984)
–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Average crust (Weaver & Tarney 1984)
–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
REE
LILE
HFSE
Plots
Plots
Uloží parametry binárního nebo
ternárního grafu pro
opakované použití do souboru
Vyvolání pomocí menu:
File | Source R code
Plots
Blabla2
Plots - peterplot
Ano  přiřadí symboly pro použití v dalších graf. výstupech
INTERMEZZO - ukládání
Teoreticky:
•
rastrový (bitmapový) formát (.bmp, .png, .jpg)
– minimální možnost dalších úprav
+ jednoduché vkládání do textu (Word)
•
vektorový formát (.ps, .wmf)
– náročnější na počítačovou gramotnost uživatele
+ bohaté možnosti editace ve vektorovém editoru (CorelDraw)
 doporučená metoda
•
formát .pdf - bez software Adobe nezpracovatelný
•
kopírování přes schránku - obě první možnosti
INTERMEZZO - ukládání
Prakticky:
•
v menu GCDkit | Save all
graphics ...
•
V menu File (okno s grafem musí
být aktivní)
•
Přes kontextové menu (pravé
tlačítko myši)
Menu
Classification
Classification
Projekce do nejpoužívanějších
klasifikačních diagramů
detailní popis diagramů - viz nápověda
fungování:
•
standardní sada dialog. Oken
•
...
Classification
•
vykreslení grafu
•
nabídka klasifikace jednotlivých
vzorků
•
možnost připojit výsledky k
proměnné labels pro pozdější
použití
•
souhrnné výsledky - R-console
•
detailní v proměnné results
Classification
Irvine T N & Baragar W R A (1971) A guide to the chemical classification of
the common volcanic rocks. Can J Earth Sci 8: 523-548
Classification
Peccerillo R & Taylor S R (1976) Geochemistry of Eocene calc-alkaline
volcanic rocks from the Kastamonu area, Northern Turkey. Contrib
Mineral Petrol 58: 63-81
Classification
Shand (1943) Eruptive Rocks. John Wiley & Sons
Classification
TAS digram nabízí i kompletní klasifikaci dle
IUGS (členění trachytických hornin, hi-Mg
hornin a test na obsah CO2 a H2O)
Le Bas M J, Le Maitre R W, Streckeisen A & Zanettin B (1986) A chemical
classification of volcanic rocks based on the total alkali-silica diagram. J
Petrology 27: 745-750
Classification
Cox K G, Bell J D & Pankhurst R J (1979) The Interpretation of Igneous
Rocks. George Allen & Unwin, p. 1-450 (see help for details)
Classification
Jensen L S (1976) A new cation plot for classifying subalkalic volcanic
rocks. Ont Div Mines, Misc Pap 66, 1-21 (see help for details)
Classification
De La Roche H, Leterrier J, Grandclaude P & Marchal M (1980) A
classification of volcanic and plutonic rocks using R1 - R2 diagram and
major element analyses - its relationships with current nomenclature.
Chem Geol 29: 183-210
Classification
Winchester J A & Floyd P A (1977) Geochemical discrimination of different
magma series and their differentiation products using immobile elements.
Chem Geol 20: 325-343
Classification
Winchester J A & Floyd P A (1977) Geochemical discrimination of different
magma series and their differentiation products using immobile elements.
Chem Geol 20: 325-343
Classification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of
common plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci
73: 135-149
Classification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of
common plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci
73: 135-149
Classification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of
common plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci
73: 135-149
Menu
Geotectonic
Geotectonic
Mantle Fractionates
Post-collision Uplift
Anorogenic
Post-orogenic
Pre-plate Collision
Late-orogenic
Syn-collision
Batchelor R A & Bowden P (1985) Petrogenetic interpretation of granitoid
rock series using multicationic parameters. Chem Geol 48: 43-55
Geotectonic
IAG
CCG
RRG
CEUG
Maniar P D & Piccoli P M (1989) Tectonic discriminations of granitoids. Geol Soc Amer Bull 101: 635-643
Island Arc Granitoids
CAG Continental Arc Granitoids
Continental Collision Granitoids POG Post-orogenic Granitoids
Rift-related Granitoids
OP Oceanic Plagiogranites
Continental Epeirogenic Uplift Granitoids
Geotectonic
ORG
VAG
WPG
COLG
Ocean Ridge Granites
Volcanic Arc Granites
Within Plate Granites
Collision Granites
Pearce J A, Harris N W & Tindle A G (1984) Trace element discrimination
diagrams for the tectonic interpretation of granitic rocks. J Petrology 25: 956-983
Geotectonic
Geotectonic
AI-AII
AII-C
B P-type
D N-type
C-D
Within-Plate Alkaline Basalts
Within-Plate Tholeiites
Mid-Ocean Ridge Basalts
Mid-Ocean Ridge Basalts
Volcanic Arc Basalts
Meschede M (1986) A method of discriminating between different types of
mid-ocean ridge basalts ... Chem Geol 56: 207-218
Geotectonic
CAB
IAT
MORB
OIA
OIT
Calc-Alkaline Basalts
Island Arc Tholeiites
Mid-Ocean Ridge Basalts
Ocean Island Andesites
Ocean Island Tholeiites
Mullen E D (1983) MnO/TiO2/P2O5: a minor element discriminant for
basaltic rocks of oceanic environments ... . Earth Planet Sci Lett 62: 53-62
Geotectonic
IAT
MORB
CAB
WPB
Low-K Tholeiites
Ocean Floor Basalts
Island Arc Basalts
Within Plate Basalts
Pearce J A & Cann J R (1973) Tectonic setting of basic volcanic rocks
determined using trace element analyses. Earth Planet Sci Lett 19: 290-300
Geotectonic
Within-plate Basalts
Island-arc basalts
Mid-ocean Ridge Basalts
Pearce J A & Norry M J (1979) Petrogenetic implications of Ti, Zr, Y, and Nb
variations in volcanic rocks. Contrib Mineral Petrol 69: 33-47
Geotectonic
Spreading Center
Orogenic
Ocean Ridge
Ocean Island
Continental
Pearce T H, Gorman B E & Birkett T C (1977) The relationship between
major element geochemistry ... . Earth Planet Sci Lett 36: 121-132
Geotectonic
IAT
CAB
N-MORB
E-MORB
WPT
WPA
Island-arc Tholeiites
Calc-alkaline Basalts
N-type Mid-ocean Ridge Basalts
E-type Mid-ocean Ridge Basalts
Within-plate Tholeiites
Alkaline Within-plate Basalts
Menu
Plot editing
Plot editing
Implemenatace systému FIGARO pro vynášení a úpravy grafů v R
(autor C.M. Farrow)
Všechny úpravy se týkají naposledy použitého grafu !
Plot editing
Plot editing
Plot editing
Plot editing
Další použitelné parametry - viz nápověda
Plot editing
Graf definovaný pomocí systému FIGARO lze:
• Uložit do souboru včetně dat (Save a graph)
• Načíst ze souboru (Load a graph)
• Překreslit (Redraw)
Plot editing
Vložení:
• legendy
• libovolného textu (včetně stylu, barvy a velikosti)
• šipky (včetně barvy a stylu)
• obdélníku (včetně barvy)
Plot editing
Linear fit: Proložení dat regresní přímkou (metoda nejmenších čtverců)
Proložit lze i podle jednotlivých skupin
Curve: vložení uživatelem definované křivky
Plot editing
Zoom - zvětší oblast označenou myší, kterou
zároveň vyšrafuje v původním grafu
Myší je třeba klikat v pořadí levý dolní roh, pravý
horní roh zoomované oblasti
Měnit lze i rozsah jednotlivých os
Plot editing
Identifikace bodů - interaktivně (popisky)
Zvýraznění bodů - podle zadané
podmínky (červené kroužky)
Plot editing
Vykreslí grafy pro jednotlivé skupiny (groups)
Pro přehlednost je namístě vypnout zobrazování textů v menu
GCDkit | plot annotations on plots?
Plot editing
Definice skupin na základě polí označených
pomocí myši v diagramu (barvy byly
novým skupinám přiřazeny v menu
Data handling)
Plot editing
Vloží izolinie kernelové hustoty bodů
jako parametr lze zadat šířku pásma
(bandwidth)
Plot editing
Vykreslí izolinie podle hustoty bodů v
polích pravidelné sítě
Vhodné pro velmi rozsáhlé datové
soubory ( > 1000 bodů)
That’s all,
folks!
Hah, hah,
hah ...