No Slide Title

Download Report

Transcript No Slide Title

Enzimoloģija/Metabolisms
Transferāzes. To klasifikācija. Pārmetilēšanās procesi. Liāzes. Adenilāt
ciklāze.Izomerāzes. Galaktozes metabolisms. Sintetāzes.
Molekulāras bioloģijas (bioķīmijas)katedra 2008/2009. akad.gads
Pārmetilēšanās procesi
kobalamīns
kobalamīns
Sukcinīl-KoA
Metīlmalonīlmutāze
Metionīn sintāze (KF.2.1.1.13) darbojas pēc ping-pong mehānisma
Kobamīd enzīmu katalizētās reakcijas:
1.
2.
3.
4.
Metīlmalonīlmutāze (metīlgrupu pārneses)
Metionīn sintāze
Leicīn aminomutāze
Kobamīdenzīma katalizētā ribonukleotīdreduktāze
Vitamīns B12 vai kobalamīns, oksi, metīl, ciano- kobalamīni.
Kobalta atoms saistīts slāpekļa makrocikla korrīna reducētu
tetrapirolu sistēmā: I un IV pirola gredzeni savienoti bez
metīna tiltiņa
I
IV
IUBMB Enzyme Nomenclature
EC 5.4.3.7
Accepted name: leucine 2,3-aminomutase
Reaction: (2S)-α-leucine = (3R)-β-leucine
Systematic name: (2S)-α-leucine 2,3-aminomutase
Comments: Requires a cobamide coenzyme.
Links to other databases: BRENDA, EXPASY, KEGG, ERGO, CAS registry
number: 59125-53-0
References:
1. Freer, I., Pedrocchi-Fantoni, G., Picken, D.J. and Overton, K.H.
Stereochemistry of the leucine 2,3-aminomutase from tissue-cultures of
Andrographis paniculata. J. Chem. Soc. Chem. Commun. (1981) 80-82.
2. Poston, J.M. Leucine 2,3-aminomutase, an enzyme of leucine catabolism. J.
Biol. Chem. 251 (1976) 1859-1863. [PMID: 1270414]
3. Poston, J.M. Coenzyme B12-dependent enzymes in potatoes: leucine 2,3aminomutase and methylmalonyl-CoA mutase. Phytochemistry 17 (1976) 401402.
Ribonukleotīdu pārveidošana dezoksiribonuleotīdos
CDP,ADP,GDP
NADH2
FAD
2SH
Tioredoksīnreduktāze
NAD
FADH2
S-S
Tioredoksīns
B12
2S-S
2 SH
2SH
UDP
Ribonuleotīdreduktāze, Se
(KF.1.8.1.9)
S-S
dUDP
Pārskats par vienoglekļa savieojumu veidošanos, izlietošanu,
holīna cikls, betaīni, tetrahidrogēnfolskābes nozīme
Metilēto savienojumu funkcijas var būt visdažādākās
Anserine (beta-alanyl-N-methylhistidine) is a dipeptide. Found in the skeletal
muscle and brain of mammals, it is an antioxidant and helps reduce fatigue. The
pKa of the imidazole ring of histidine, when contained in anserine, is 7.04,
making it an effective buffer at physiologic pH.
Trigonelline is an alkaloid with chemical formula C7H7NO2. It is an inner salt
formed by the addition of a methyl group to the nitrogen atom of nicotinic acid.
Trigonelline is a product of the metabolism of niacin (vitamin B3) which is
excreted in the urine.[1]
Trigonelline is also found in coffee, where it may help to prevent dental caries by
preventing the bacteria Streptococcus mutans from adhering to teeth.
Melatonīns veidojas vairāk tumsā un nospiež
seksuālhormonu sintēzi
Adenilātciklāzes telpiskā uzbūve
Heptahelikālā - heterotrimērā receptora darbība:
1. Ligands saistās ar heptahelikālo receptoru,
2. Receptors saists trimēro proteīnu,
3. Saistītā G proteīna  subvienība GDF vietā saista GTF,
4. GTP un G proteīna saistība isauc trimēra disociāciju,
5. GTF- subvienība aktivē adenilātciklāzi,
6. -subvienība hidrolizē GTF,
7. Veidojas GDF un G-proteīna trimērs.
Tālākās signāla transdukcijas piemērs pēc
cikliskā AMF izveidošanās
Citu cukuru ieslēgšanās metabolismā II
glikoze
Laktoze
beta-galaktozidāze
galaktoze
galaktozes -1-P
UDF glikoze
Galaktozīl-1-fosfāturidīltransferāze
(Galaktozēmija)
glikozes-1-P
UTF
UDF- galaktozīl-pirofosforilāze
P-P
UDF - galaktoze
UDF-glukozoepimerāze
1) Glikoproteīni
2) Glikolipīdi
3) Konjugācijai
UDF-glikoze
3’-ACC...