Transcript Pročišćavanje proteina

H
C
O
H
C
O
OH
C
H
H
C
HO
CH2OH
L-gliceraldehid
H
H
COOH
CH2OH
D-gliceraldehid
COOH
H
C
C
C
C
COOH
cis-spoj
H
COOH
trans-spoj
Tablica 1.2. Važne organske kiseline i nazivi njihovih soli (u zagradama).
H
COOH
mravlja kiselina
(formijat)
H3C
CH2
CH2
COOH
HOOC
COOH
H
CH2
CH2
COOH
jantarna kiselina
(sukcinat)
COOH
CH2
CH
CH
CH
COOH
OH
OH
vinska kiselina
(tartarat)
H2C
CH2
C
H3C
H2C
COOH
COOH
ketoglutarna kiselina
(ketoglutarat)
COOH
CH2
CH2
COOH
COOH
glutarna kiselina
(glutarat)
CH
COOH
COOH
H3C
C
COOH
O
pirogrožðana kiselina
(piruvat)
CH2
C
O
oksaloctena kiselina
(oksalacetat)
O
CH2
C
OH
mlijeèna kiselina
(laktat)
OH
jabuèna kiselina
(malat)
COOH
HOOC
HOOC
H
fumarna kiselina
(fumarat)
COOH
COOH
malonska kiselina
(malonat)
COOH
C
CH2
propionska kiselina
(propionat)
oksalna kiselina
(oksalat)
maslaèna kiselina
(butirat)
HOOC
H3C
H3C
COOH
octena kiselina
(acetat)
COOH
Aminokiseline:
1.
2.
3.
4.
Dvije funkcionalne grupe COOH i NH2
Dipolarni ioni, izoelektrična točka
Optička aktivnost
20 aminokiselina kao građevni blokovi peptida i proteina
Ogranci: alifatski, hidroksilni, aromatski, bazični, kiseli, amidni,
sumporni
Peptidi:
1. Peptidna (amidna) veza,
2. Funkcije: redoks-sustav (glutation)
neuropeptidi (endorfini, enkefalini)
peptidni hormoni (inzulin)
antibiotici (penicilin, kloramfenikol, tetraciklini)
otrovi (amanitin, faloidin)
Proteini:
- enzimi
- strukturni proteini (kolagen, elastin)
- kontrakcija mišića (aktin, miozin)
- živčani podražaj (rodopsin)
- prenosioci molekula (albumin)
- imunost (antitijela)
Strukturna organizacija proteinske molekule:
1. Primarna struktura (redoslijed aminokiselina)
2. Sekundarna struktura (-uzvojnica, -nabrana ploča, kolagenska
uzvojnica)
3. Tercijarna struktura (prostorni oblik cijele molekule)
4. Kvaterna struktura (prostorni raspored molekule s podjedinicama)
Međumolekulske veze koje izgrađuju i stabiliziraju proteinsku
molekulu:
1.
2.
3.
4.
Vodikove veze (sekundarna, tercijarna i kvaterna struktura)
Ionska privlačenja (tercijarna i kvaterna struktura)
Van der Waalsove veze (tercijarna struktura)
Hidrofobne interakcije (tercijarna struktura)
Disulfidni mostovi – kovalentna veza između ostataka cisteina koja
sudjeluje u stvaranju sekundarne strukture.
Pročišćavanje proteina:
-taloženje (topljivost)
-kromatografija: gel filtracija (veličina molekule)
ionski izmjenjivači (naboj molekule)
afinitetna kromatografija (sposobnost vezanja na
određene grupe)
Elektroforeza: metoda za određivanje čistoće preparata zasnovana
na sposobnosti potovanja proteina u električnom polju.
KOENZIM
Kratica
Prenesena grupa
Pripadni vitamin
nikotinamid-adenin-dinukleotid
NADH
vodik
nikotinska kis.
nikot.-adenin-dinukleotid-fosfat
NADPH
vodik
nikotinska kis.
flavin-mononukleotid
FMN
vodik
riboflavin
flavin-adenin-dinukleotid
FAD
vodik
riboflavin
ubikinon
Q
vodik
I.Prijenosnici vodika
stanični hemini
liponska kiselina
elektroni
Lip
vodik i acil
adenozin-trifosfat
ATP
fosfat (AMP)
sulfat fosfoadenilne kiseline
PAPS
sulfat
piridoksal-fosfat
PLP
amino grupa
citidin-difosfat
CDP
fosforil-holin
uridin-difosfat
UDP
šećeri, uronati
adenozil-metionin
SAM
metilna grupa
tetrahidrofolna kiselina
H4-folat
formilna grupa
folna kiselina
karboksil grupa
biotin
II.Prijenosnici grupa
piridoksin
Prijenosnici C1 jedinica
biotin
Prijenosnici C2 jedinica
koenzim A
CoA
acetil (acil)
pantotenska kis.
tiamin-difosfat
TPP
C2-aldehidne gr.
tiamin
III. Koenzimi izomeraza i liaza
uridin-difosfat
izomer. šećera
piridoksal-fosfat
dekarboksilacija
piridoksin
tiamin-difosfat
dekarboksilacija
tiamin
B12 koenzim
premještaj CO2
kobalamin