Transcript Retro

Wirusy odwrotnie
transkrybujące
Retroviridae
Hepadnaviridae
Rodzina: Retroviridae
Rodzaj:
Alpharetrovirus
Betaretrovirus
Gammaretrovirus
Deltaretrovirus
Epsilonretrovirus
Lentivirus
Spumavirus
http://www.unites.uqam.ca/biologie_moleculaire/ima
ges/retrovirus1.jpg
Rodzaj:
Alpharetrovirus (avian type C)
wirus białaczki ptaków
wirus mieloblastozy ptaków
wirus mięsaka Rousa
Rodzina: Retroviridae
Rodzaj:
Betaretrovirus
wirus gruczolakowatości płuc owiec
Rodzaj:
Gammaretrovirus (mammalian type C)
wirus białaczki kotów
Rodzaj:
Deltaretrovirus (BLV-HTLV)
wirus enzootycznej białaczki bydła
ludzkie wirusy T-limfotropowe
Rodzaj:
Lentivirus
HIV-1
BIV
NZK
2 cząsteczki ssRNA”+” RT, 7-11 kb, połączone
mostkiem wodorowym
http://www.stanford.edu/group/nola
n/tutorials/images/proteins.jpg
Klasyczny genom retrowirusa
LTR
4 geny -
gag
pro
pol
env
LTR
gag - białka wewnętrzne, 3-6, matrix, kapsyd
pro - proteaza
pol - odwrotna transkryptaza (RT)
env - białka otoczki
LTR pol
env
v-onc
LTR
LTR
env
gag
pol
LTR
v-onc
LTR
gag
LTR
pol
v-onc
LTR gag
pol
env
LTR
v-onc
LTR gag
env
LTR
v-onc
delecje powodują powstawanie cząstek replikacyjnie
defektywnych, zależnych od nietransformujących helperów
V-onc
Sis - czynnik wzrostowy
Erb, Fms, Kit, Ros - białka membranowe o
srukturze receptorów dla czynnika wzrostu
Src, Abl, Yes - membranowe kinazy tyrozynowe
Ras - białko G transdukujące sygnały
Jun, Fos, Myc - białka jądrowe - czynniki
transkrypcyjne
replikacja genomu
przepisanie ssRNA”+” na ss cDNA”-” przez RT
zniszczenie wirionowego RNA przez aktywność RNA-zy H
RT
synteza cDNA”+” - powstanie ds cDNA z dwoma LTR
integracja ds cDNA z genomem komórki - może zachodzić
w wielu miejscach, prowirus nie może się przemieszczać
transkrypcja mRNA i wirionowego ssRNA”+” przez
komórkową RNA-polimerazę II pod wpływem sygnałów
zawartych w LTR
Cykl replikacyjny HIV znajdziesz TU
Rodzina: Hepadnaviridae
Rodzaj:
Orthohepadnavirus
Avihepadnavirus
http://web.uct.ac.za/depts/mmi/stan
nard/hepb.html
sferyczne, czasem pleomorficzne, 40-48 nm, otoczkowe
kolisty DNA, częściowo ds, częściowo ss
nić „-” ma pełną długość 3-3.3 kb z dołączonym na
końcu 5’ białkiem
nić „+” ma na końcu 5’ oligorybonukleotyd 19 nt
4 geny (HBV):
3 u kaczego
S - antygen powierzchniowy
C - rdzeń
P - odwrotna transkryptaza
o aktywności DNApolimerazy i RNA-zy H
X - prawdopodobnie
transaktywator
powstają 3 transkrypty: 3.4, 2.4 i 2.1 kb
3.4 kb - do translacji białka rdzenia c i RT oraz do
syntezy nici „-” DNA na drodze odwrotnej transkrypcji,
przy użyciu startera białkowego
na gotowej nici „-” dobudowywana jest druga nić („+”),
w efekcie powstaje genomowy dsDNA
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book
=mmed&part=A2301&rendertype=figure&id=A2303
uszkodzenia hepatocytów (i całej wątroby) wynikają
prawdopodobnie z autoagresji - na powierzchni
zakażonych komórek dochodzi do ekspresji antygenu c
(HbcAg) i hepatocyty te atakowane są przez komórki
cytotoksyczne
u hepadnawirusów integracja wirusowego DNA z
genomem gospodarza jest sporadyczna i często niestabilna
w odróżnieniu od retrowirusów, zintegrowany wirusowy
DNA może się przemieszczać, co prowadzi do rearanżacji
genomu gospodarza
aktywacja komórkowych protoonkogenów (c-onc) sporadyczna (erbA, c-myc)
RÓŻNICE W REPLIKACJI RETRO- i HEPADNAWIRUSÓW
RETRO
RNA
starter RNA
LTR
integracja we wszystkich
zakażonych komórkach i jest
częścią procesu replikacji
HEPADNA
DNA
starter białkowy
brak LTR
integracja sporadyczna,
RETRO
odwrotna transkrypcja dotyczy
genomowego RNA i prowadzi
do wytworzenia dsDNA-kopii
genomu RNA
HEPADNA
odwrotna transkrypcja dotyczy
„niegenomowego” RNA i
prowadzi do wytworzenia nici „” genomowego kwasu
nukleinowego