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被捕食者-捕食者相互作用在兩個微生物反應槽串聯之穩定度和
動態分析
王祥雲、胡真熏、 林浩
南台科技大學化學工程與材料工程系
摘要
本研究實施被捕食者-捕食者(prey-predator)間相互作用之生化反應,在兩個微生物反應槽串聯
之穩定狀態的穩定度分析和動態分析。此生化反應系統主要由Substrate Inhibition模式來表示被捕食者
之比生長速率,而由Monod模式來表示捕食者之比生長速率,對於被捕食者-捕食者(prey-predator)間
相互作用之生化反應系統,其中之一種微生物(捕食者),可由捕食另一種微生物(被捕食者)而獲
取養分。
此反應系統共有六種型態之穩定狀態,本研究對此六種型態之穩定狀態的穩定度作深入的分析。對
於動態分析部分,本研究運用數值分析方法來求解系統之動態方程式,並運用電腦繪圖來進行動態分
析,在動態分析的過程中,除了繪捕食者,被捕食者,及基質對反應時間之動態圖外,並作三度空間
圖以便深入的分析此反應系統之動態行為,動態分析的結果顯示此生化反應系統之動態行為可為穩定
之穩態(Stable Steady State)或循環振盪(Limit Cycle)。
1、前言
對於生化反應系統之穩定狀態和動態之研究已經實施好幾年了,而對於生化反應系統之穩定狀態
和動態分析曾由多位學者提出這方面的研究報告。最近幾年來由於生化污染,生物廢棄物的處理之普
及,微生物的混合培養技術,深受大家的重視。又在河口水域中常存在微生物集團中之捕食關係,對
於被捕食者-捕食者(prey-predator)間相互作用之生化反應系統,其中之一種微生物(捕食者),可
由捕食另一種微生物(被捕食者)而獲取養分。對於被捕食者-捕食者間相互作用之生化反應系統的
穩定狀態和動態分析,曾由Canale等人(1973);及Pavlou(1985)提出這方面的研究報告。
本研究實施被捕食者-捕食者(prey-predator)間相互作用之生化反應,在兩個微生物反應槽串聯
之穩定狀態和動態分析。此兩個微生物反應槽串聯之反應系統共有六種型態之穩定狀態,由此系統之
穩定狀態方程式可解得穩定狀態值,本研究並對此六種型態之穩定狀態作深入的分析,對於此反應系
統之動態行為,由於動態微分方程式之複雜性,則由電腦運用數值分析的方法進行分析工作,本研究
並對不同組參數進行動態分析。
2、研究材料與方法
本研究採用之方法以數學及數值分析方法為主。對於此生化反應系統的穩定狀態方程式,運用
數學方法來導出其穩定狀態。對於動態分析部分,由於動態微分方程式之複雜性,故運用阮奇─庫特
(Runge-Kutta)數值分析的方法求解系統之動態方程式,並運用電腦繪三度空間動態圖來進行分析工
作。
3、結果與討
論
表1列舉一組參數之穩定狀態值、特徵值與穩定度,1-D不穩定表示三個特徵值中有一個特徵值之
實部為正值;2-D不穩定表示三個特徵值中有兩個特徵值之實部為正值;3-D穩定表示三個特徵值
之 實 部 均 為 負 值 。 表 1 之 參 數 值 為 μm=0.56hr-1 , νm=0.1hr-1 , Ki=16mg/L , Kp=10000mg/L ,
L=6.1mg/L,X=0.73,Y=0.428,D1=0.0175hr-1,D2=0.0175hr-1,sf =250mg/L,ka=0hr-1,kb=0hr-1 。
圖1和2之參數值與表1相同。圖1和2顯示循環振盪(Limit Cycle)之動態行為。
4、結論
此生化反應系統共有六種型態的穩定狀態,由此系統之穩定狀態方程式,可解得此六種型態
之穩定狀態值,本研究對此六種型態之穩定狀態分別作深入的分析。對於動態分析部分,由於動
態微分方程式之複雜性,故運用阮奇─庫特(Runge-Kutta)數值分析的方法求解系統之動態方程式,
並運用電腦繪動態圖來進行分析工作。循環振盪之動態行為顯示在同一段時間內其振盪數為相同,
並且持續不斷的循環振盪。由電腦用數值分析的方法,對不同組參數作分析的結果顯示此反應系
統之動態行為,可為穩定之穩態(Stable Steady State)或循環振盪(Limit Cycle),且動態分析之結果
與表1之結果相一致。
5、參考文獻
[1] Canale, R.P., Lustig, T.D., Kehrberger, P.M. and Salo, J.E. , “Experimental and Mathematical
Modeling Studies of Protozoan Predation on Bacteria” , Biotechnol. and Bioeng., Vol.15, pp.707-728
(1973).
[2] Pavlou, S., “Dynamics of a Chemostat in Which One Microbial Population Feeds on Another,”
Biotechnol. and Bioeng., Vol. 27, pp.1525-1532 (1985).
[3] Ajbar, A., “Classification of Static and Dynamic Behavior in Chemostat for Plasmid-Bearing,
Plasmid-Free Mixed Recombinant Cultures,” Chem. Eng. Comm., Vol.189, pp.1130-1154 (2002).
[4] Kim, H and Pagilla, K.R., “Competitive Growth of Gordonia and Acinetobacter in Continuous Flow
Aerobic and Anaerobic/Aerobic Reactors,” J. Bioscience and Bioeng., Vol.95, pp.577-582 (2003).
[5] Aggelis, G., Vayenas, D.V., Tsagou, V. and Pavlou, S., “Prey-Predator Dynamics with Predator
Switching Regulated by a Catabolic Repression Control Mode”, Ecological Modelling, Vol.183,
pp.451-462, (2005).
[6] Upadhyay, R.K., Iyengar, S.R.K., “Effect of Seasonality on the Dynamics of 2 and 3 Species PreyPredator Systems”, Nonlinear Analysis: Real World Applications, Vol.6, pp.509-530, (2005).
[7] Gakkhar, S., Singh, B., “Dynamics of Modified Leslie–Gower-Type Prey-Predator Model with
Seasonally Varying Parameters”, Chaos, Solitons and Fractals, Vol.27, pp.1239-1255, (2006).
此生化反應系統可用下列動態方程式表示︰
dp1
  D1 p1   b1  p1  k a p1
dt
ds1
1
 D1 s f  s1   s1 b1
dt
Y


(1)
(3)
db2
1
 D2 b1  b2    s2 b2   b2  p2  kbb2 (5)
dt
X
db1
  D1b1   s1 b1 
1
 b1  p1  kbb1
表1.列舉一組參數之穩定狀態值、特徵值與穩定度
(2)
dt
X
dp2
 D2  p1  p2   b2  p2  k a p2 (4)
dt
ds2
1


 D2 s1  s2   s2 b2 (6)
dt
Y
式中p1=第一個微生物反應槽之捕食者(predator)之濃度(mg/L),b1=第一個微生物反應槽之被捕食者
(prey)之濃度(mg/L),s1=第一個微生物反應槽之基質(substrate)之濃度(mg/L),p2=第二個微生物反應
槽之捕食者(predator)之濃度(mg/L),b2=第二個微生物反應槽之被捕食者(prey)之濃度(mg/L),s2=第二
個微生物反應槽之基質(substrate)之濃度(mg/L),sf =進料之基質之濃度(mg/L),X=捕食者之總增殖收
率,Y=被捕食者之總增殖收率,F=流速(L/hr),V1=第一個微生物反應槽之體積(L),V2=第二個微生物
反應槽之體積(L),D1=F/V1=第一個微生物反應槽之稀釋率(hr-1),D2=F/V2 =第二個微生物反應槽之稀
釋率(hr-1),ka=捕食者之死亡率係數(hr-1),kb=被捕食者之死亡率係數(hr-1)。若此反應系統由Substrate
Inhibition模式來表示被捕食者之比生長速率而由Monod模式來表示捕食者之比生長速率時
 s  
μm s
2
s
Ki  s 
KP
(7)
νm b
νb  
Lb
(8)
第一個微生物反應槽:
穩定狀態之
型態
p1(mg/L)
1
0
2
0
3
4
5
6
0
0
0
26.180
穩定狀態值
b1(mg/L)
s1(mg/L)
0
250.0
0
250.0
0
106.779
106.779
1.294
250.0
0.516
0.516
163.186
λ1
-0.0175
-0.0175
特徵值
λ2
-0.0175
-0.0175
-0.0175
-8.1950
-8.1948
0.0421+
0.0742i
-0.0175
-0.0175
-0.0175
0.04210.0742i
穩定度
λ3
0.4967
0.4967
1-D不穩定
1-D不穩定
0.4967
0.0771
0.0771
-0.0175
1-D不穩定
1-D不穩定
1-D不穩定
2-D不穩定
參數值:
μm=0.56hr-1,νm =0.1hr-1,Ki=16mg/L,Kp=10000mg/L,L=6.1mg/L,X=0.73,Y=0.428,
D1=0.0175hr-1,D2=0.0175hr-1,sf =250mg/L,ka=0hr-1,kb=0hr-1
第二個微生物反應槽:
μm,Ki,Kp=正值常數;νm=最大比生長值(hr-1)、L=飽和常數(mg/L)
此反應系統共有六種型態的穩定狀態:
(1) p1=0 , b1=0 , s1=sf , p2=0 , b2=0 , s2=sf
(2) p1=0, b1=0 , s1=sf , p2=0 , b2>0 , s2>0
穩定狀態之
型態
p2(mg/L)
1
0
2
0
3
26.180
穩定狀態值
b2(mg/L)
s2(mg/L)
0
250.0
106.779
0.516
1.294
163.186
(3) p1=0 , b1=0 , s1=sf , p2>0 , b2>0 , s2>0
4
5
6
(4) p1=0, b1>0 , s1>0 , p2=0 , b2>0 , s2>0
(5) p1=0, b1>0 , s1>0 , p2>0 , b2>0 , s2>0
(6) p1>0, b1>0 , s1>0 , p2>0 , b2>0 , s2>0
每一個型態的穩定狀態之穩定度,可由系統方程式之Jacobian矩陣之特徵值來作分析。如
果一個穩定狀態,其系統方程式之Jacobian矩陣的所有特徵值之實數部分(實部)皆為負值,則此
穩定狀態為穩定。
0
77.142
29.781
107.000
1.294
0.132
0.001
0.073
154.375
λ4
-0.0175
-8.1952
0.0421+
0.0742i
-8.7664
-1.1762
-0.1473
特徵值
λ5
-0.0175
-0.0175
0.04210.0742i
-0.0175
-0.0175
-0.0260
穩定度
λ6
0.4967
0.0771
-0.0175
1-D不穩定
1-D不穩定
2-D不穩定
0.0771
-0.1227
-0.0175
1-D不穩定
3-D穩定
3-D穩定
參數值:
μm=0.56hr-1,νm =0.1hr-1,Ki=16mg/L,Kp=10000mg/L,L=6.1mg/L,X=0.73,Y=0.428,
D1=0.0175hr-1,D2=0.0175hr-1,sf =250mg/L,ka=0hr-1,kb=0hr-1
對於第一個微生物反應槽,方程式(1)~(3)之Jacobian矩陣為

 D1   (b1 )  k a

  1  (b )
1

X


0

d
(
) p1
db1
1 d
 D1   ( s1 )  (
) p1  k b
X db1
1
  ( s1 )
Y

0


d

( )b1

ds1
1 d 
 D1  ( )b1 
Y ds1 
對於第二個微生物反應槽,方程式(4)~(6)之Jacobian矩陣為

 D2   (b2 )  k a

  1  (b )
2

X


0

d
(
) p2
db2
1 d
 D2   ( s 2 )  (
) p2  kb
X db2
1
  (s2 )
Y

0


d

(
)b2

ds 2

1 d
 D2  (
)b2 
Y ds 2 
圖1 p1,b1,s1之三度空間圖;t =1000-2000hr,
D1=0.0175hr-1,D2=0.0175hr-1;循環振盪(Limit
Cycle)
圖2 p2,b2,s2之三度空間圖;t =1000-2000hr,
D1=0.0175hr-1,D2=0.0175hr-1;循環振盪(Limit
Cycle)