13장 핵산의 구조와 기능, 대사
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생화학
13장. 핵산의 구조와 기능
1. 피리미딘 염기와 퓨린 염기
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<퓨린>
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<피리미딘>
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2. 오탄당 – 리보오스와 디옥시리보오스
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3. 뉴클레오시드
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4. 핵산의 기본 구성
뉴클레오티드 : 뉴클레오시드의 5’-OH에 인산이 결합한 구조
핵산(nucleic acid, NA) : 뉴클레오티드들이 일직선으로 연결된 중합체
연결된 뉴클레오티드의 순서가 유전적 정보를 나타냄
핵산의 종류 : DNA와 RNA
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1) 뉴클레오티드
뉴클레오티드 구성 성분 : 질소 함유하는 염기, 오탄당, 인산
뉴클레오티드 : 뉴클레오시드에 인산이 1~3개까지 에스테르 결합된 것
주로 5’-위치에 인산기를 갖음
뉴클레오시드에 인산기가 3개 붙은 5’-dNTP 또는 5’-NTP : 에너지 대사 및 저장
DNA 및 RNA 합성 전구체로 이용
cAMP나 cGMP : 호르몬처럼 세포 내에서 조절작용으로 사용
뉴클레오시드 5’-이인산 : 조효소의 일부로 사용
아데노신5’-이인산 : 산화환원반응에 작용
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2) 뉴클레오티드 의 인산다이에스테르결합
뉴클레오티드 : 뉴클레오시드의 5’-OH에 인산이 결합한 구조
핵산(nucleic acid, NA) : 뉴클레오티드들이 일직선으로 연결된 중합체
50개 이하의 짧은 핵산 : 올리고뉴클레오티드, 그 이상은 폴리뉴클리오티드
인산 다이에스테르 연결은 사슬의 방향에 따라 동일한 방향을 가짐 : 5’ -> 3’
(5’-말단, 3’말단)
연결된 뉴클레오티드의 순서가 유전적 정보를 나타냄
핵산의 종류 : DNA와 RNA
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5. DNA와 RNA
DNA(deoxy ribonucleic acid)
분포
물질적 특성
구조
종류, 기능
RNA(ribonucleic acid)
세포핵
세포질(cytosol)
백색의 견사(실) 상태
분말 상태
2가닥의 사슬이 A=T, G≡C의
수소결합으로 이중나선 형성
1가닥, 부분적인 이중나선구조
염색체의 성분으로 단백질
합성시 아미노산 배열순서
정보 간직(유전자)
tRNA(전달 RNA) : 아미노산을
ribosome으로 운반
rRNA(리보솜 RNA) : 단백질의
합성장소
mRNA(전령 RNA) : DNA에서
주형을 전사하여 유전정보를
간직, 단백질 합성에 관여
hnRNA(이성질핵 RNA) : 핵에
들어있는 mRNA전구체
snRNA(소핵 RNA) : intron을
제거하고 exon만을 연결하여
RNA를 절단 가공
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<DNA>
mononucleotide사이의 결합은 phosphodiester결합이다.
poly nucleotide에서 3번 탄소에 결합성 OH가 있는 말단을 3’ 말단, 5번 탄소에
결합성 OH가 있으면 5’말단
2가닥의 polynucleotide는 α-helix(이중나선)구조이다.
2가닥의 polynucleotide는 3’,5’ 말단이 서로 거꾸로 배치된 역평형구조
2가닥의 polynucleotide는 염기와 염기 사이에 수소결합을 하고 있어 쉽게 풀어
지지 않음
염기 사이의 수소결합은 반드시 adenine과 thymine, guanine과 cytosine이 결합
하는 상보적인 관계를 유지
염기 사이의 수소결합은 A=T, G≡C 로 G와 C사이의 결합이 더 강함
α-helix 1회전은 10개의 mononucleotide로 구성되며 거리는 3.4 nm
DNA는 가열하면 α-helix 구조가 붕괴되는데 이 변성온도를 융점이라 함
가열 후 냉각하면 다시 α-helix구조로 돌아가는 성질(annealing)이 있음
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<RNA>
mononucleotide사이의 결합은 phosphodiester결합이다.
RNA 분포비율 : rRNA 82%, tRNA 16%, mRNA 2%
mRNA - DNA 일부가 판박이(template)가 되어 생성됨
- 리보솜으로 이동함
- DNA의 유전정보를 단백질 합성에 전달하는 메신저 역할을 함
rRNA - mRNA 주형으로부터 단백질을 합성하는 기관
tRNA - 아미노산을 리보솜으로 운반하는 역할
- 20가지 아미노산마다 다름
- 평면 구조가 클로버 모양 또는 열십자 모양
- 3’말단에 CCA로 되어 있음
- 마지막의 아데닌산에 아미노산을 결합시켜 운반
- 변형염기가 존재
- 자기가 운반하는 아미노산의 코돈(유전 정보)에 반대되는 역코돈을
갖고 있음
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<RNA>
코돈(codon) - mRNA에서 20가지 아미노산 이름을 뜻하는 3개의 염기서열
- 3개의 염기가 1개의 아미노산을 지칭
- 각 아미노산은 1개로부터 6개까지의 코돈을 가짐
역코돈(anticodon) - 각 tRNA는 자기 운반하는 아미노산의 codon에 반대되는
codon을 갖고 있으며 이를 역코돈이라 함
G와 C, A와 U 염기간 수소결합을 함
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6. Purine 염기와 pyrimidine 염기의 대사
1) 생합성
<purine 염기>
반응 : 13단계 효소반응
탄소 공급원 : glycine, CO2, THF(tetrahydrofolate)
질소 공급원 : glutamine, aspartic acid
경로 : ribose-5-인산 PRPP IMP AMP, GMP
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<pyrimidine 염기>
탄소 공급원 : carbamoyl phosphate
질소 공급원 : aspartic acid
경로 : CO2 + Gln + ATP carbamoyl phosphate carbamoyl asparate
UMP UTP CTP
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2) 분해
<purine 염기>
AMP IMP hypoxanthine xanthine uric acid allantoin
allantoic acid urea + glyoxylic acid
인간 : uric acid 형태로 배설
기타 포유류, 파충류 : allantoin 형태로 배설
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<pyrimidine 염기>
경로 :
* cytosine uracil dihydrouracil β-ureidopropionic acid CO2 + NH3
* thymine dihydrothymine β-ureidoisobutyric acid CO2 + NH3
포유 동물은 이미 합성된 pyrimidine 염기를 분해 배설시키지 않고 일부는 TCA 회로
로 들어가서 분해가 되는 회수경로( savage phthway)를 갖고 있음
* Cytosine uracil
acetyl-CoA TCA cycle
* Thymine succinyl CoA TCA cycle
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7. DNA 복제
DNA 복제는 반보전적임 - 2가닥의 새로운 DNA 중 1가닥은 원래 존재하던 가닥임
- 다른 한 가닥은 새로 합성된 가닥임
DNA 복제는 양쪽 방향성임 - 두 가닥이 동시에 5’ 3’ 방향으로 진행함
DNA 복제 과정 - 한 DNA(모세포) 에서 새로운 DNA(딸세포)를 합성하는 과정임
DNA 풀림 primer 합성 DNA 합성 DNA조각의 연걸
DNA 복제 관여 효소 :
* DNA polymerase I - DNA 주형, dNTP, Mg2+, primer 필요
* DNA polymerase III - 사슬연장 반응, DNA 합성(5’ 3’)
3’ 5’ exonuclease
* DNA ligase - NAD+ 혹은 ATP를 사용하여 두 DNA 조각을 phosphodiester결합
형성하여 연결하는 효소
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<DNA 복제과정>
①
DNA의 이중나선구조를 풀어줌(나선효소, helicase)
②
풀어진 가닥이 다시 꼬이지 못하게 수소결합을 방해함(단일가닥 결합단백질)
③
선도 가닥은 DNA polymerase III 작용으로 5’ 3’ 방향으로(상보적으로 결합)
④
지연 가닥은 시발효소(primase)가 짧은 RNA인 시발물질(복제개시점)을 만들고, 여
기에 DNA polymerase III 가 5’ 3’ 방향으로 수많은 오카자키 조각을 형성
⑤
지연 가닥이 전부 합성되면 exonuclease가 시발물질을 제거
⑥
시발 물질이 있던 자리는 DNA polymerase I의 작용으로 자리를 메움
⑦
여러 개의 오카자키 조각은 DNA 연결효소(DNA ligase)가 연결하여 완전한 지연 가
닥의 DNA를 생성
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