Base physique IRM Séquences « Echo de Spin » et « Echo de Gradients » Magnetic Resonance Imaging (MRI) Kernspintomography Jacques Felblinger UHP- INSERM U947 [email protected].
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Base physique IRM Séquences « Echo de Spin » et « Echo de Gradients » Magnetic Resonance Imaging (MRI) Kernspintomography Jacques Felblinger UHP- INSERM U947 [email protected] Bibliographie http://www.imaios.com/fr/e-Cours/e-MRI/RMN - IRM pas à pas - Guide des technologies de l’imagerie médicale, Masson, Dillenseger/Moerschel - Collection d'imagerie radiologique, Comprendre l'IRM, Masson, B Kastler - MRI from Picture to Proton, , Cambridge, McRobbie et al. - Handbook of MRI, Pulse Sequences, Bernstein et al - Magnetic Resonance Imaging, Springer, M Vlarrdingerbroek - MRI, physical Principles and Sequence Design, Haake et al Le Web ISMRM www.imaios.com/fr/e-Cours/e-MRI/RMN GRAMM ESMRMB JMRI et MRM GE Healthcare PHILIPS Medical Systems SIEMENS Medical Solutions Bruker Biospin Varian Fréquence de résonance, fréquence de Larmor Excitation, émission d’énergie Récupération, réception d’énergie B = * B B1: u = fréquence de résonance (Hz) = rapport gyromagnétique (fonction de l'atome) B0 = 1.5 Tesla, u= 64 MHz = 64 000 000 Hz 1ère expérience IRM (1) Générateur + Amplificateur + Antenne d’émission Bo Numérisation + Amplificateur + Antenne de réception Antenne de réception Champ magnétique + Antenne d’émission 1ère expérience IRM (1) Générateur + Amplificateur + Antenne d’émission Bo Numérisation + Amplificateur + Antenne de réception Emission B1 (RF) Réception t Free Induction Decay (FID) t Sequence IRM (Pulse Sequence Diagram) 1ère expérience IRM (2) Emission B1 (RF) t Mz Free Induction Decay (FID) t Réception Mxy y e-t/T2 x Relaxation transversale, T2 Différente fréquence = Déphasage Origine de la chute plus rapide du signal fréquence 1 y fréquence 2 fréquence 1 fréquence 2 x Différentes fréquences = somme vectorielle chute vite T2 Différentes fréquences = liées à la structure moléculaire liées à la qualité du champ magnéique 1ère expérience IRM (2) Emission B1 (RF) Réception t Free Induction Decay (FID) t Cas 1 (idéal) Champ Magnétique parfait: décroissance T2 e-t/T2 B0 homogéne Fréquence du signal = Fréquence de résonance Signal = ρ . sin (ωt). exp(-t/T2) 1ère expérience IRM (2), cas réel t Emission B1 (RF) Free Induction Decay (FID) t B = Réception * B Cas 2 (réalité) Champ Magnétique imparfait, Molécule complexes: décroissance T2* e-t/T2* B0 Gradient de champ magnétique = r * B + 0 B devient B+DB F devient F+DF Gradient: continue de - DB à + DB toutes les fréquences -1,5mT +1,5mT -64000Hz +64000Hz 63 936 000Hz 1) sélection d'une coupe 2) codage de l'information 64 064 000Hz 1,500 T 64 000 000Hz 1 Mz 0.9 0.8 0.7 0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 Mxy 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 Longitudinal, T1 y 1 0.9 0.8 0.7 0.6 x 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 50 100 150 200 250 Transversale, T2 300 Relaxation T1 Excitation puis retour à l'équilibre (spin-réseau) constante de temps T1, Longitudinale Mz=Mo(1-exp(t/T1)) 1 0.9 T1=500 ms 5*T1= 98% 0.8 0.7 63% 0.6 T1graisse=260ms T1muscle=870ms T1 LCR=2400ms Retour À l’équilibre 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 Relaxation T2 Signal IRM: Free Induction Decay (FID), Transversale interaction spin-spin constante de temps T2 Mz=exp(t/T2)) T2<<T1 1 0.9 0.8 T2=50 ms 5*T2= 98% 0.7 0.6 63% 0.5 0.4 T2 graisse=80ms T2 muscle=45ms T2 LCR=160ms 37% 0.3 Plus de signal 0.2 0.1 0 0 50 100 150 200 250 300 Révision (B0, B1, T1, T2) Aimant (magnet): dispositif produisant le champ magnétique principal (appelé B0) = 1,5T Antenne (coil) : Élément utilisé en IRM pour l’émission et le recueil du signal. ( tête, cou, abdomen, pelvis, membre, etc..) Champ Radiofréquence : Onde radiofréquence similaire à celles utilisées pour la radiodiffusion (appelé B1) 64MHz à 1,5T 128MHz à 3T pour retour à l’équilibre B Constantes de Temps T1 et T2 T1 = relaxation longitudinale T2 = relaxation transversale = * B T1 et T2 = fonction de la structure moléculaire T2* relaxation réel (champ magnétique non homogène) (en pratique) Homogénéité de B0 B0= 1,5T -> fréquence de Larmor = 64 000 000Hz Zone homogène B0 - B0 est homogène seulement dans une sphère de 50 cm au milieu de l’aimant. homogénéité en ppm (décalage 1/1000 000, quelques mT = quelques Hz) - Conséquence: il faut toujours déplacer la région d’intérêt au milieu de l’aimant - Réglage de homogénéité = SHIM (pour les séquences sensibles, pour les extrémités) (un peu de pratique) Orientation B0 et B1 B0 B0 dans l’axe du tunnel Par définition: axe z Axe antenne dans Plan perpendiculaire B0 B0 Antennes dédiées Spine Torso-pelvis Coeur Extremities Extrémités Antennes volumiques Antennes de surface Orientation B0 et B1 B0 Comment placé une antenne cou Idéalement? Signal? Angle de bascule (flip angle) TransmitRF Energie t Emission B1 (RF) 1,2 1 0,8 0,6 ReceiveRF Réception t 0,4 0,2 0 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 -0,2 0° 90° 180° Angle de bascule α =90° le plus de signal, bascule dans le plan xy Angle de bascule (flip angle) Angle de bascule en degrés 90° = max signal, mais on peut appliquer moins une impulsion de 90°, passage plan transversal Plus l’angle est petit, moins d’énergie est transmise Plus vite on peut recommencer une nouvelle mesure Mz Mxy Révision (B0, B1, angle de bascule) B0 = champ magnétique (permanent) Homogénéité = sphère de 40-50 cm de diamètre Réglage du champ magnétique = Shim (bobine additionnelle) B1 = Champ radiofréquence (impulsion courte ms) Antenne émission ou réception perpendiculaire à l’axe de B0 Angle de bascule (amplitude + durée de l’impulsion radiofréquence) = énergie Angle de bascule = 90° = bascule dans plan transversal B0 Comment comprendre l’IRM ? 1) Quelques expériences de base a) Comprendre d’où vient le signal b) Relaxation T1, T2, T2* c) Echo de spin (spin echo) d) Echo de gradients (Gradient Echo) B = * B 2) Contraste en IRM 3) Formation de l’image a) Excitation d’une coupe b) Codage en fréquence c) Codage en phase d) « vrai » séquence IRM Echo de Spin (Spin Echo) 180 90 Emission B1 (RF) t FID t Réception TE/2 pas phasé phasé déphase Déphasé Inversion progressif déphasage TE/2 Rephasage progressif phasé Echo de spin 180 90 RF TE/2 TE/2 echo z M Signal b c d e f g O Temps x y (ingrédients d’une séquence) Echo de Spin 180 90 Echo TE/2 TE/2 Bascule dans plan xy Déphasage Inversion Déphasage TE = temps d’écho Annule les inhomogénéités de B0!!! (défauts) Donc atténuation T2 pas T2* Echo Lecture t Echo de Gradient a TE RF echo z Signal M Gradient O b c d ee f x Temps y Echo de gradients t + - φ B0 t B0 x FID T2* t (ingrédients d’une séquence) Echo de Gradient α Echo TE/2 TE/2 Bascule pas dans le plan xy Déphasage Rephasage Par gradient TE = temps d’écho Reste sensible aux inhomogénéités de B0!!! (défaut) T2* pas T2 Echo Lecture t Séquence Spin Echo/Echo de Gradient TR 90 180 Echo ligne 90 180 Echo ligne TE TR α Echo ligne TE α Echo ligne α Echo ligne α Echo ligne Séquence Spin Echo/Echo de Gradient TR 90 180 Echo ligne 90 180 Echo ligne Beaucoup de temps d’attente en SE (multicoupe…) Remplissage plus rapide de l’espace k TR α Echo ligne α Echo ligne α Echo ligne α Echo ligne Séquence Spin Echo/Echo de Gradient TR 90 180 Echo 90 180 Echo Energie Radiofréquence: 180° très énergétique! (SAR) TR α Echo α Echo α Echo α Echo Séquence Spin Echo/Fast Spin Echo TR 90 180 Echo ligne 90 180 Echo ligne TR 90 180 TE1 Echo ligne 180 TE2 Echo ligne 180 Echo ligne TEeffectif Une seule exitation mais plusieurs lectures 12-20 échos = lignes: Train d’échos (ETL) Révision (TR, TE, Spin Echo, Echo de Gradient) TR =temps de répétition = temps entre deux acquisitions successives TE = temps d’écho = temps auquel l’écho est généré = signal mesurable Angle de bascule = 90° - 180° pour une séquence spin écho, <90° en écho de gradients Echo de Spin = séquence de base, corrige les inhomogénéités de B0, lente Echo de gradients = séquence rapide, ne corrige pas les inhomogénéités de B0 Fast Spin Echo = 90° - 180° -180°- 180° -180°……. Plusieurs lignes Comment comprendre l’IRM ? 1) Quelques expériences de base a) Comprendre d’où vient le signal b) Relaxation T1, T2, T2* c) Echo de spin (spin echo) d) Echo de gradients (Gradient Echo) B = * B 2) Contraste en IRM 3) Formation de l’image a) Excitation d’une coupe b) Codage en fréquence c) Codage en phase d) « vrai » séquence IRM B Equation du signal = a) * B Perturbation (changement de niveau d’énergie), impulsion radiofréquence b) Retour à l’équilibre en fonction de 2 constantes de temps T1 et T2 Dépend de la séquence d’acquisition Equation du signal pour une séquence Echo de Spin Mz=Mo (1-exp(-TR/T1)) exp (-TE/T2) attente lecture Temps de répétition TR=temps de répétition 1 Emission B1 (RF) t 0.9 0.8 0.7 0.6 FID 0.5 0.4 t Réception 0.3 0.2 0.1 0 0 500 1000 1500 2000 TR long > 5T1 Emission B1 (RF) Réception t FID t 2500 3000 Relaxation T1 Excitation puis retour à l'équilibre constante de temps T1, Longitudinale Mz=Mo(1-exp(t/T1)) 1 0.9 T1=500 ms 5*T1= 98% 0.8 0.7 Retour À l’équilibre 63% 0.6 0.5 T1graisse=260ms T1muscle=870ms T1 LCR=2400ms 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 Relaxation T2 Signal IRM: Free Induction Decay (FID), Transversale interaction spin-spin constante de temps T2 Mz=exp(t/T2)) T2<<T1 1 0.9 0.8 T2=50 ms 5*T2= 98% 0.7 0.6 63% 0.5 0.4 T2 graisse=80ms T2 muscle=45ms T2 LCR=160ms 37% 0.3 Plus de signal 0.2 0.1 0 0 50 100 150 200 250 300 Contraste T2 Long délai avant la mesure (TR>2s) = pas de contraste T1 1 0.8 T1 Graisse 260ms T1 Muscle 870ms 0.6 0.4 0.2 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000 4500 5000 1 0.8 T2 Graisse 80ms T2 Muscle 45ms 0.6 0.4 0.2 0 TE 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 Mesure trop tôt = peu de contraste T2 (TE=100ms) Contraste T2 Long délai avant la mesure (TR>2s) = pas de contraste T1 1 0.8 T1 SB 780ms T1 SG 900ms T1LCR 2400ms 0.6 0.4 0.2 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000 4500 5000 1 T2 SB 90ms T2 SG 100ms T2 LCR 160ms 0.8 0.6 0.4 TE 0.2 0 0 50 100 150 200 250 300 350 400 Mesure trop tôt = peu de contraste T2 (100ms) Pondération T1 Délai court entre mesures (TR=500ms) = contraste T1 1 0.8 T1 Graisse 260ms T1 Muscle 870ms 0.6 0.4 0.2 0 0 100 200 300 400 500 600 700 1 0.8 0.6 T2 Graisse 80ms T2 Muscle 45ms TE 0.4 0.2 0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 Mesure tôt = peu de contraste T2 200 Pondération T1 Délai court entre mesures (TR=500ms) = contraste T1 0.5 0.4 SB 780ms SG 900ms LCR 2400ms 0.3 0.2 0.1 0 0 100 200 300 400 500 600 700 800 900 0.5 T2 SB 90ms T2 SG 100ms T2 LCR 160ms 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 50 100 150 200 250 300 350 Mesure tôt = peu de contraste T2 400 Pondération densité Délai long entre mesures (TR>2000ms) = pas de contraste T1 1 0.8 T1 Graisse 260ms T2 Muscle 870ms 0.6 0.4 0.2 0 0 500 1000 1500 2000 2500 1 0.8 T2 Graisse 80ms T2 Muscle 45ms 0.6 0.4 0.2 0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 Mesure tôt= peu de contraste T2 (<20ms) Révision (Pondérations T1, T2) Pondération T1 n’est pas la mesure de T1, mais la mise en évidence des différences de T1 (idem pour T2) Il est possible de mesure les valeurs réelles de T1 et T2 = mesure longue, peu utilisé en pratique clinique TR long = pas de contraste T1 (relaxation totale) TR court = contraste T1 TE court = pas de contraste T2 (peu de relaxtion T2) TE long = contraste T2 TE trop long = plus de signal Pondération T1 = TR court + TE court Pondération T2= TR long + TE « long » Pondération densité = TR long + TE court Contraste en IRM En fonction des paramètres d’acquisitions, TR,TE, angle etc.. différents contrastes sont possibles TR/TE 2500/30 densité de proton TR/TE 2500/90 pondérée T2 TR/TE 460/11 pondérée T1 Comment comprendre l’IRM ? 1) Quelques expériences de base a) Comprendre d’où vient le signal b) Relaxation T1, T2, T2* c) Echo de spin (spin echo) d) Echo de gradients (Gradient Echo) B = * B 2) Contraste en IRM 3) Formation de l’image a) Excitation d’une coupe b) Codage en fréquence c) Codage en phase d) « vrai » séquence IRM Codage en phase et en fréquence Coupe Séquence= sélection coupe + codage k Z Image brute puis transformée de Fourier Espace k (matrice) Plan Phase Y Image (matrice) TF X Fréquence Remplissage espace k coupe + RF Codage phase lecture Coupe Coupe Excitation Excitation Préparation Acquisition X lignes de phase…. Préparation Acquisition Remplissage espace k (rapide) Coupe Excitation coupe + RF Codage phase lecture X lignes de phase…. Préparation Préparation Préparation Acquisition Acquisition Acquisition Excitation d'une coupe (slice) Sélection de la coupe fréquence 10 mT/m Excitation Réception Résonance Transformée de Fourier Pas de tranche parfaite…… Gradient de phase t Gradient de champ magnétique = fréquence de précession différente Pendant durée du gradient Déphase du signal lié à la localisation Pas de gradient t y x Nouvelle expérience IRM (1) Emission B1 (RF) t Free Induction Decay (FID) t Réception Gradient coupe Gradient Coupe+ refocalisation pour “rattraper” les déphasages du gradient de sélection de coupe Gradient de champ entraine un déphasage Une vrai séquence Echo de spin RF Gz (coupe) Gy (phase) Gx (lecture) Signal TE/2 TE/2 TR Aimantation résiduelle T1 long…. Normalement il faut attendre longtemps.. Avant de refaire une nouvelle acquisition. 1 0.9 T1=500 ms 5*T1= 98% 0.8 0.7 Retour À l’équilibre 63% 0.6 0.5 T1graisse=260ms T1muscle=870ms T1 LCR=2400ms 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 Aimantation résiduelle TR = temps de répétition 180 90 90 Echo t TE Bascule dans plan xy Déphasage α α Lecture α Détruire l’aimantation résiduelle: Spoiler, Crusher, …. Gradient ou RF: l’idée est de déphaser, mélanger…. Echo Lecture Révision (Séquence) Séquence = Excitation (sélection du plan de coupe) + déphasage (codage 1) + lecture (codage 2) Remplir le plan de Fourier, nb de ligne de phase = temps = nombre de TR Un gradient de champ magnétique = déphasage du signal Compensation de chaque gradient de champ magnétique par un gradient inverse TR = répétition, Matrice = temps d’acquisition il est possible de supprimer l’aimantation résiduelle pour commencer la nouvelle acquisition plus rapidement, déphasage du signal par gradient de champ magnétique 1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) Séquence écho de spin Séquence Fast Spin Echo Séquence écho de gradient Effet des gradients SAR et Spin echo SAR et Gradient écho Pondération/T1 T2 Questions: [email protected]