November 2, 2015 REAXYS How you think How you work Elsevier 教育訓練講師 劉惠賢 Karen Liu.

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November 2, 2015
REAXYS
How you think How you work
Elsevier 教育訓練講師
劉惠賢 Karen Liu
•REAXYS化學資料庫簡介
收錄內容 & 界面更新
•Searching in REAXYS
主題1 :化合物搜尋
主題2 :反應搜尋
主題3 :合成計畫
主題4 :文獻搜尋
•Analyzing in REAXYS
視覺化分析工具 – Analysis View
多樣化結果輸出功能 – Enhanced Report
自動合成工具 – Autoplan
•Q&A
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REAXYS化學資料庫簡介
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REAXYS資料來源
400種常用
化學期刊
Advanced Synthesis Catalysis
Journal of Organometallic Chemistry
JACS; Synlett; Tetrahedron
Journal
世界、美國
、歐洲
專利資料庫
Patent
REAXYS
CrossFire
有機化學
資料庫
Gmelin
無機及
有機金屬
化學資料庫
REAXYS資料擷取方式
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REAXYS化學資料庫內容革新
Reaxys在2013年四月進行界面更新、內容新增及整併三大新功能,除了站
穩化學資料庫之領導地位,更能全方位支援研究人員的工作流程!
•內容新增:
內容將從原有的400本嚴選期刊及專利,擴充至16,000筆化學相關出版品!
內容涵蓋學科領域已從核心化學到以下學科:
Agricultural and Biological Sciences
Biochemistry, Genetics and
Molecular Biology
Chemical Engineering
Chemistry
Dentistry
Earth and Planetary Sciences
Energy
Engineering
Environmental Science
Immunology and Microbiology
Materials Science
Medicine
Neuroscience
Pharmacology, Toxicology and
Pharmaceutics
Physics and Astronomy
Veterinary
•操作界面更新:新版搜尋介面依據不同使用者,建立不同搜尋路徑!
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REAXYS 聯結多種資料庫,資訊獲取更便利
為了讓使用者能容易查找相關資訊,Reaxys 聯結到許多Elsevier 內部或外部資
料庫,讓使用更加便利。
• PubChem — 在Reaxys 介面在您搜尋資料結果時可以連到NCBI開放的資料庫,以獲取
小分子生物活性資料。
• eMolecules —可以獲取國外原料藥的購買資訊,包含廠牌、容量與價格,以幫助“
合成或購買”的決策過程。
• Reaxys Medicinal Chemistry —根據分子標靶、藥理作用和標靶相互作用數據之主要
資料來篩選和優先考慮候選藥物
• PharmaPendium —深入臨床和臨床前數據,並能搜尋FDA內的藥品審查資訊及相關
歷史資料。
• Scopus —享有使用重要的文獻計量學的資訊結果,包含引用資訊及期刊分析等。
• ScienceDirect — 可獲取Elsevier 文章和電子書全文資料下載及使用多種便利的應用程
式。
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REAXYS Homepage
新版資料庫入口有三種入口:
依結構搜尋、非依結構搜尋及文獻搜尋,方便不同領域使用者選擇進入!
依結構搜尋(Structures & Reactions):可輸入化學結構來搜尋反應式、化合
物及文獻,並可按下Reaction Data加入附加搜尋條件。
非結構搜尋(Names & Formulas):可輸入化學名稱等方式來搜尋特定化合物,並
可按下Physical、Spectra、Bio Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。
文獻搜尋(Literature):可選擇欄位
並輸入關鍵字來搜尋相關文獻。
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附加搜尋條件設定
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SEARCH IN REAXYS
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主題 1 : 化合物搜尋_非依結構搜尋
非依結構搜尋:適用於初學者一開始進行化學搜尋或任何不易以畫結構方式
做搜尋的分子,如:無機分子。
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主題 1 :化合物搜尋_非依結構搜尋
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主題 1 :化合物搜尋_依結構搜尋
依結構做搜尋:使用者可利用繪圖軟體繪製要搜尋的分子或反應式,或是藉
由化合物名轉換成結構的方式做搜尋!
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主題 1 : 化合物搜尋_依結構搜尋
搜尋項目:可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。
反應搜尋條件:基本設定
另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。
若要增加搜尋條件可按下 Physical、Spectra、Bio
Activity及Natural Product加入附加搜尋條件。
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MarvinSketch
Reaxys Generics
Template Library
利用MarvinSketch線上繪圖軟
體繪製分子/試劑結構
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Periodic System
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主題 1 : 搜尋範例 - Thalidomide
• Thalidomide是最早上市的非處方鎮定劑,很多國家曾用於懷孕婦女的噁心
、嘔吐症狀,卻也造成在1960年代上千位畸形兒的產生,因此而聲名狼藉…
最近幾年讓一些研究學者更感興趣的是
Thalidomide的:
1.抗發炎作用(anti-inflamatory)
2.免疫調節(Immunomodulatory)
3.抑制血管增生(anti-angiogenic)
抗血管新生作用(Antiangiogenesis Activity)
(1) 血液腫瘤
(2) 多發性骨髓瘤(Multiple
Myeloma)
(3) 肝癌 (Hepatocellular
Carcinoma, H.C.C.)
不良反應
(1)致畸胎
(2)週邊神經病變
(3)副作用:嗜睡,暈眩等
參考網站:http://www.tmn.idv.tw/cchtumor/drug/drug07.htm
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主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide
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主題 1 : 化合物搜尋_ SAHA
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主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide
輸出
Report
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主題 1 : 化合物搜尋_Thalidomide
多樣化結果輸出功能(Report):只要有
如:搜尋條件、搜尋結果集合成計畫等。
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圖示處皆可輸出至Report,
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
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主題 2 : 反應搜尋
搜尋項目:可使用繪圖軟體以結構的方式來搜尋反應、化合物及文獻。
啟用線上繪圖軟體MarvinSketch/Elemental來畫結構
反應搜尋條件
另可依據化合物名稱、InChI-Key及Smiles來做搜尋。
提供Elemental、MarvinSketch等讓使用者選擇繪製分子結構或
反應的軟體;預設為MarvinSketch(需JAVA支援),可點擊空
白處兩下以啟動。
搜尋:反應、化合物 & 文獻搜尋
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主題 2 : 反應搜尋_Reaction Data
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MarvinSketch
Reaxys Generics
Template Library
利用MarvinSketch線上繪圖軟
體繪製分子結構/反應式
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Periodic System
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主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide
• 沙利竇邁的合成 – Thalidomide
輸入化合物名稱Thalidomide並轉換
成結構
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主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide
限縮項目:建議使用Analysis View以圖像的方式同時分析兩種欄位。
輸搜尋結果
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主題 2 : 反應搜尋_Thalidomide
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視覺化分析工具 - Analysis View
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
合成計畫
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主題3 : 合成計畫 - Thalidomide
Report
Report
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多樣化結果輸出功能_Report
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主題4 : 文獻搜尋_Literature
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主題4 : 文獻搜尋_Literature
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主題4 : 文獻搜尋_Literature
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主題4 : 文獻搜尋_Literature
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主題4 : 文獻搜尋 - Thalidomide
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主題4 : 文獻搜尋 - Thalidomide
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多樣化結果輸出功能 - Enhanced Report
輸出結果
搜尋紀錄輸出
反應搜尋結果輸出
化合物搜尋結果輸出
文獻搜尋結果輸出
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相關資源
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相關資源
Reaxys info : http://www.reaxys.com/info
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Elsevier台灣官網: Reaxys資訊下載
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http://taiwan.elsevier.com
Facebook
www.facebook.com/reaxysclub
FB粉絲團:最新消息與討論
Q&A
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如有相關問題請連絡
•劉惠賢
• [email protected]
• 電話:(02)2522-5911
相關網頁
• www.reaxys.com (首頁)
• taiwan.elsevier.com (台灣官網)
• www.facebook.com/reaxysclub (FB粉絲團)