5V066 - BMC

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Intitulé de l’UE : ANALYSES STATISTIQUES ET TRAITEMENT DE DONNEES EXPERIMENTALES MULTIVARIEES
Code de l’UE : 5V066
Responsables de l’UE :
Secrétariat :
Frédérick GAY, Maître de Conférences - Praticien Hospitalier
Mel : [email protected]
Dominique LAMY, Maître de Conférences UPMC
Mel : [email protected]
Cédric HUBAS, Maître de Conférences MNHN
Mel : [email protected]
Nicoletta PERRET
Tél. : 01 44 27 34 36
Mel : [email protected]
1. Descriptif de l’UE
Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage autre…) : 60 h (25 h CM + 25 h TD + 10 h Travail
personnel)
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Mention et spécialité de Master où l’UE est proposée : Mention "Biologie Moléculaire & Cellulaire"
Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 3 du Master (13 – 24 avril 2015)
Effectifs prévus : 24
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
Cette unité d'enseignement a pour objectif d’aider les étudiants à comprendre et de leur apprendre à
faire par eux-mêmes les analyses statistiques mettant en jeu plusieurs variables explicatives concomitamment. Le programme couvre le domaine des modélisations ainsi que celui des analyses de
données multivariées descriptives. Chaque analyse est d’abord abordée dans son principe avant
d’être aussitôt mise en pratique à travers des exemples à l’aide du logiciel R. Pour ce faire, chaque
étudiant travaille sur un poste informatique individuel.
b) Thèmes abordés
- Rappels sur : principe des tests, R, corrélation, régression, Chi2, ANOVA
- Modélisations :
- ANOVA à plusieurs dimensions
- Plans d’expériences
- Régressions (linéaire multiple, logistique, de Poisson, PLS)
- Analyse des données censurées (modèle de Cox)
- Modèles linéaires généralisés
- Modèles non linéaires
- Modèles non paramétriques
- Analyses multivariées descriptives :
- ACP
- AFC
- Classifications
- ACM & analyse discriminante
- AFM
- NMDS
- RDA
- CCA
c) Organisation pédagogique
L'enseignement se déroule sur deux semaines à plein temps.
d) Pré-requis
Le pré-requis porte sur les notions de bases en statistiques, la maitrise des tests bivariés paramétriques et non-paramétriques et la pratique du logiciel R (maitrise du langage de base pour l’écriture
de scripts) (cf. programme de l’UE 4V333). Le « petit nom » de cette UE 5V066 est « Stats
d’Argent » alors que celui de la 4V333 est « Stats de Bronze ».
3. Equipe pédagogique
Equipe d’enseignants : Frédérick Gay, Dominique Lamy & Cédric Hubas.
La formation est construite en entités autonomes. Chaque analyse est traitée en théorie puis en pratique sous R de sorte que l’étudiant s’en approprie le principe et le savoir faire au cours de la même
séance.