AHL - iGEM 2008
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Transcript AHL - iGEM 2008
送受信チーム
冨永将大・川崎浩平・井山佳美
目標:
gfp発現のタイミングをコントロール
1時間タイマー
1 hour
5時間タイマー
4 hours…
1 hour
Still inactive
active
細胞間コミュニケーション
シグナル分子の蓄積
クオラムセンシング
クオラムセンシング
Sender cell
produce AHL
Receiver cell
AHL gfp expression
pc
luxR
LuxI
pc
luxI
LuxR
AHL
蓄積
plux
gfp
AHLの蓄積
通常AHL通信
LuxI
LuxR
AHL感受性変更通信
?
LuxR
求められること
AHL
AHLs
感度の異なるAHL受信装置の作成
クロストークの利用
Part:BBa_F2620:Specificity
http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620:Specificity
Quorum sensing
由来生物
Autoinducer
R:Group
Autoinducer
synthase
V.Fisheri
(3OC6)
P.aeruginosa
(3OC12)
P.aeruginosa
+
(C3)
AHL
基本構造
(C6)
LuxI
LuxR
lasI
lasR
RhlI
RhlR
cinI
cinR
R.leguminosarum
(3OH14C)
Recepter Protein
求められること
RhlI
RhlI
LuxI
LasI?
CinI?
Part:BBa_F2620:Specificity
http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620:Specificity
シグナル分子(=AHL)の変更
《クロストーク》
Autoinducer synthase
LuxI
lasI
cinI
RhlI
LuxR
plux
gfp
タイムディレイテスト
通信条件
•温度
37℃、30℃
•大腸菌株
JW1908、XL10GOLD
•菌数比
Receiver / Sender = 1
10
100
タイムディレイテスト(クロストーク)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
37℃ or 30℃
Senders
LuxI
lasI
RhlI
?
タイムディレイテスト(Cross-talk)
Receiver-JW1908
Senders-XL10Gold
plac
plac
LuxI
lasI
plac RhlI
ptet
LuxR
plux
gfp
cross-talkの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 1 : 1
37℃
30℃
LuxI
LuxI
RhlI
RhlI
LasI
LasIのみ、delay発生+低い
LasI
タイムディレイテスト(TAG効果)
Senders-XL10Gold
Receiver-JW1908
plac LuxI
ptet
plac
LuxI
LVA
plac RhlI
plac RhlI
LVA
LuxR
plux
gfp
LVA-Tagの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender =1 : 1 (30℃)
LuxI
RhlI
Tagなし
Tagつき
Tagの効果:最大値の低下
Tagなし
Tagつき
LVA-Tagの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 10 : 1
LuxI
Tagなし
( 30℃ )
RhlI
Tagなし
Tagつき
Tagつき
Senderを少なくする→Tagの効果UP+delay発生
AHL合成が少ないとき効果あり
タイムディレイテスト(温度依存性)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
37℃ or 30℃
Senders
LuxI
lasI
RhlI
?
温度の影響は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 1 : 1
37℃
30℃
LuxI
LuxI
RhlI
RhlI
LasI
LasI:30℃の方が強い
LasI
タイムディレイテスト(株依存性)
Senders-JW1908
Senders-XL10Gold
plac
LuxI
plac
LuxI
plac
lasI
plac
lasI
plac RhlI
plac RhlI
Receiver-JW1908
ptet
LuxR
plux
gfp
株の影響は?
Receiver : Sender = 1 : 1 (37℃)
JW1908
XL10GOLD
RhlI
LuxI
RhlI
LuxI
LasI
LasI
タイムディレイテスト(菌数比の影響)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
30℃
?
Senders
Receiver / Sender
(R/S) = 1
LuxI
lasI
RhlI
=10
=100
菌数比の影響は?
30℃、JW1908
RhlI
LasI
S/R=10
S/R=1
S/R=10
S/R=100
S/R=1
S/R=100
実験の流れ
テスト準備(8/17~)
バラバラなパーツの組み直し
CrrosTalkテスト(9/2~)
Lux
Las
Rhl
Cin
Lux
Las
Rhl
Cin
タイムディレイテスト(液体培地)
(9/8~9/25)
Today
タイムディレイテスト(固体培地)
(9/26~)
タイムディレイテスト(固体培地spot)
XL10GOLD , Receiver / Sender = 1, 37℃
LuxI
LasI
RhlI
2h後
8h後
5h後
ptet
LuxR
plux
結果予想図
→輪の広がる速度に差が出る
Receiver-JW1908
gfp
New Parts
BBa_K084008
plac RhlI
BBa_K0840012
plac luxI
BBa_K084009
plac RhlI
BBa_K084014
plac luxI
LVA
BBa_K084007
plac lasI
LVA
BBa_K084010
plac
cinI
LVA