AHL - iGEM 2008

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Transcript AHL - iGEM 2008

送受信チーム
冨永将大・川崎浩平・井山佳美
目標:
gfp発現のタイミングをコントロール
1時間タイマー
1 hour
5時間タイマー
4 hours…
1 hour
Still inactive
active
細胞間コミュニケーション
シグナル分子の蓄積
クオラムセンシング
クオラムセンシング
Sender cell
produce AHL
Receiver cell
AHL gfp expression
pc
luxR
LuxI
pc
luxI
LuxR
AHL
蓄積
plux
gfp
AHLの蓄積
通常AHL通信
LuxI
LuxR
AHL感受性変更通信
?
LuxR
求められること
AHL
AHLs
感度の異なるAHL受信装置の作成
クロストークの利用
Part:BBa_F2620:Specificity
http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620:Specificity
Quorum sensing
由来生物
Autoinducer
R:Group
Autoinducer
synthase
V.Fisheri
(3OC6)
P.aeruginosa
(3OC12)
P.aeruginosa
+
(C3)
AHL
基本構造
(C6)
LuxI
LuxR
lasI
lasR
RhlI
RhlR
cinI
cinR
R.leguminosarum
(3OH14C)
Recepter Protein
求められること
RhlI
RhlI
LuxI
LasI?
CinI?
Part:BBa_F2620:Specificity
http://partsregistry.org/Part:BBa_F2620:Specificity
シグナル分子(=AHL)の変更
《クロストーク》
Autoinducer synthase
LuxI
lasI
cinI
RhlI
LuxR
plux
gfp
タイムディレイテスト
通信条件
•温度
37℃、30℃
•大腸菌株
JW1908、XL10GOLD
•菌数比
Receiver / Sender = 1
10
100
タイムディレイテスト(クロストーク)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
37℃ or 30℃
Senders
LuxI
lasI
RhlI
?
タイムディレイテスト(Cross-talk)
Receiver-JW1908
Senders-XL10Gold
plac
plac
LuxI
lasI
plac RhlI
ptet
LuxR
plux
gfp
cross-talkの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 1 : 1
37℃
30℃
LuxI
LuxI
RhlI
RhlI
LasI
LasIのみ、delay発生+低い
LasI
タイムディレイテスト(TAG効果)
Senders-XL10Gold
Receiver-JW1908
plac LuxI
ptet
plac
LuxI
LVA
plac RhlI
plac RhlI
LVA
LuxR
plux
gfp
LVA-Tagの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender =1 : 1 (30℃)
LuxI
RhlI
Tagなし
Tagつき
Tagの効果:最大値の低下
Tagなし
Tagつき
LVA-Tagの効果は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 10 : 1
LuxI
Tagなし
( 30℃ )
RhlI
Tagなし
Tagつき
Tagつき
Senderを少なくする→Tagの効果UP+delay発生
AHL合成が少ないとき効果あり
タイムディレイテスト(温度依存性)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
37℃ or 30℃
Senders
LuxI
lasI
RhlI
?
温度の影響は?
XL10GOLD , Receiver : Sender = 1 : 1
37℃
30℃
LuxI
LuxI
RhlI
RhlI
LasI
LasI:30℃の方が強い
LasI
タイムディレイテスト(株依存性)
Senders-JW1908
Senders-XL10Gold
plac
LuxI
plac
LuxI
plac
lasI
plac
lasI
plac RhlI
plac RhlI
Receiver-JW1908
ptet
LuxR
plux
gfp
株の影響は?
Receiver : Sender = 1 : 1 (37℃)
JW1908
XL10GOLD
RhlI
LuxI
RhlI
LuxI
LasI
LasI
タイムディレイテスト(菌数比の影響)
LuxR plux gfp
Receiver
Mix(t=0)
蛍光強度測定
30℃
?
Senders
Receiver / Sender
(R/S) = 1
LuxI
lasI
RhlI
=10
=100
菌数比の影響は?
30℃、JW1908
RhlI
LasI
S/R=10
S/R=1
S/R=10
S/R=100
S/R=1
S/R=100
実験の流れ
テスト準備(8/17~)
バラバラなパーツの組み直し
CrrosTalkテスト(9/2~)
Lux
Las
Rhl
Cin
Lux
Las
Rhl
Cin
タイムディレイテスト(液体培地)
(9/8~9/25)
Today
タイムディレイテスト(固体培地)
(9/26~)
タイムディレイテスト(固体培地spot)
XL10GOLD , Receiver / Sender = 1, 37℃
LuxI
LasI
RhlI
2h後
8h後
5h後
ptet
LuxR
plux
結果予想図
→輪の広がる速度に差が出る
Receiver-JW1908
gfp
New Parts
BBa_K084008
plac RhlI
BBa_K0840012
plac luxI
BBa_K084009
plac RhlI
BBa_K084014
plac luxI
LVA
BBa_K084007
plac lasI
LVA
BBa_K084010
plac
cinI
LVA