Transcript PC クラスタの作り方
PC クラスタの作り方(その２) 杉山耕一朗（北大理） 2009/02/06 epnetfan PCクラスタとは • 複数台の PC をネットワーク接続することに よって構築されるメモリ分散型の並列計算機 国立天文台 CfCA 汎用 PC システム なぜ, PCクラスタ? • スパコンは性能当たりの価格が高い • 特注品よりも汎用品で 「スーパーコンピュー ティングの将来」 （牧野淳一郎）より抜粋 http://jun.artcompsci.org/a ticles/future_sc/note006.ht ml#rdocsect5 クラスタ構築プロジェクト(kodama) • 最近立ち上げ • 機材一式を購入 • 組み立て終了 • でも卒論・修論のた め，一時凍結 – 杉山が冬休みに遊ん でみただけ 本日のお話 • クラスタの構成のおさらい • 実際にサーバの設定や計算ノードの追加方 法を実演 – kodama プロジェクトの主力である４年生たちに， 簡単に作れそうだという実感を持ってもらう – 教科書となる書籍は多分無い. 構成 • ログインノード – ユーザがログインして，ジョブを投入 – 台数は, １ないし少数 • 計算ノード – 投入されたジョブを実際に計算する – ディスクレス – 台数はお好きなだけ(9 台) 起動の流れ（計算ノード） • USB メモリから起動 – USB メモり内に, カーネル が存在 – ネットワークの設定 – root システムは，ログイン ノードのディスクを NFSroot するよう設定 作業1: ログインノードの構築 • Debian のインストール • 設定 – ネットワークの設定 (NIC 2 枚挿し) – 計算ノードは private IP を利用するので. – NFS の設定 作業2: 計算ノード用カーネルの作成 • 計算ノード用のカーネルを再構築 – NFSroot – IP: kernel level autoconfiguration – NIC のドライバをカーネルに組み込む 作業 3: 計算ノードのシステムを用意 • 計算ノード用のルートシステムを用意 – debootstrap --arch=amd64 lenny /home/kodama/001 – 計算ノード用のカーネルをインストール – nfs-common, sudo, ssh 等をインストール – /etc/hosts, /etc/fstab, /etc/hostname, /etc/network/interfaces を編集 作業 4: 起動用 USB ディスクを作成 • FAT16 にフォーマットして, syslinux をインス トール． – fdisk 等でパーティション作成 – FAT16 でフォーマット – syslinux をインストール – カーネルを USB ディスクにコピー – syslinux 用の設定ファイルを用意 DEFAULT vmlinuz APPEND root=/dev/nfs rw nfsroot=192.168.90.100:/home/kodama/001 ¥ ip=192.168.90.1:192.168.90.100::255.255.255.0::: 実際に試してみる 構築メモを参考に その他 • メモリテストしたら 1 枚不良があった （40枚 中）． • スケジューラーの導入については, また後日. • MPI のインストールはこれから． • 早く DennouRuby の amd64 用の Debian パッ ケージを作って > 佐々木様 参考文献 • ディスクレスクラスタ – http://grape.mtk.nao.ac.jp/~makino/articles/diskl ess-note/doc/files/_/_diskless-note_cp.html – http://blog.asial.co.jp/329 – http://www.jp.debian.org/releases/stable/amd64 /ch04s03.html.ja – http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/NFS-RootClient.html – http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/NFS-Root.html GCOE 観測ネットワークで,… • 大容量・低価格 ファイルサーバを 作ります • 1TB x 16, 2 台 • 誰か一緒に作りま しょう 国立天文台 CfCA 大容量・低価格ファイルサーバ