SNOMED CT Padrão Terminológico e Ontológico Internacional

Stefan Schulz

Institute of Medical Informatics, Statistics and Documentation (Medical University of Graz - Austria)

SNOMED CT



Standardized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms

:    Sistema de codificação para todo o conteúdo do prontuário eletrônico Padrão terminológico global Manutenção / desenvolvimento: IHTSDO (

International Health Terminology Standards Development Organisation

): Membros: Austrália, Canadá, Chipre, Dinamarca, Estônia, Islândia, Israel, Lituânia, Malta, Nova Zelândia, Polônia, Cingapura, República Eslovaca, Eslovenia, Espanha, Suécia, Holanda, Reino Unido, Estados Unidos

SNOMED: Descenvolvimento

Descrições lógicas Fusão com CTV3 (Reino Unido) Princípios ontológicos SNOMED em UMLS Context Model Nomenclatura Patologia Nomenclatura multiaxial para toda a medicina 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005

SNOP SNOMED SNOMED II SNOMED 3.0 SNOMED 3.5 SNOMED RT SNOMED CT

IHTSDO

SNOMED CT:

 SNOMED CT como vocabulário controlado  SNOMED CT como sistema formal  SNOMED CT como ontologia

SNOMED CT como vocabulário controlado

SNOMED CT como vocabulário controlado

z.Zt.

311 000 conceitos z.Zt.

732 000 termos em Inglês Termos médicos (inclusive sinônimos e traduções) são conectados com conceitos (portadores de significado)

Déficit de versões anteriores da SNOMED

D5-46210 D5-46100 G-A231 Acute appendicitis, NOS Appendicitis, NOS Acute M-41000 G-C006 T-59200 Acute inflammation, NOS In Appendix, NOS G-A231 M-40000 G-C006 T-59200 Acute Inflammation In Appendix, NOS SNOMED INTERNATIONAL

SNOMED CT como sistema formal

SNOMED CT como sistema formal

taxonomias: especialização (is-a)

SNOMED CT como sistema formal

Restrições: lógica de descrição

C1 – Rel – C2

significa: 

x: instanceOf(x, C1)

 

y: instanceOf(C2)



Rel(x,y) ou C1

⊑ 

Rel.C2

Relações (Attributos): Associated morphology Finding site (50 tipos)

Lógica descritiva

SNOMED CT como sistema formal

 Konzepte ⊑

SNOMED CT como Ontologia

SNOMED CT como Ontologia

    Ordem de um domínio de acordo com propriedades genéricas e invariáveis Ontologia: categorias disjuntas com critérios estritos (

process, object, substance, quality

) Número restrito de relações (z.B.

part-of, has-location

, …) „Ontological commitment“: quais são as instâncias?    objetos no mundo objetos de documentação (o que está documentado sobre minha dor de cabeza conhecimento (“minha dor de estômago”) (o que o médico atualmente sabe sobre minha dor de cabeça)

SNOMED CT Top

Body structure (10) Acquired body structure Anatomical organizational pattern (…) Clinical finding (22) Administrative statuses Adverse incident outcome categories (…) Environment or geographical location Environment Geogr. and/or political region of the world Event (19) Abuse Accidental event Bioterrorism related event (…) Linkage concept Attribute Link assertion Observable entity Age AND/OR growth period Body product observable Clin. history / examination observable (21) Device observable Drug therapy observable Feature of Entity (…) (…) Organism (11) Animal Chromista Infectious agent (…) Pharmaceutical / biologic product (58) Alcohol products Alopecia preparation Alternative medicines (…) Physical force (21) Altitude Electricity (…) Physical object (8) Device Domestic, office and garden artefact Fastening (…) Procedure (23) Administrative procedure Community health procedure (…) Qualifier value (52) Action Additional dosage instructions (…) Record artifact Record organizer Record type Situation with explicit context (17) A/N risk factors Critical incident factors (…) Social context (10) Community Family Group (…) Special concept Namespace concept Navigational concept Non-current concept Specimen (45) Biopsy sample Body substance sample Cardiovascular sample (…) Staging and scales (6) Assessment scales Endometriosis classification of American Fertility Society (…) Substance (11) Allergen class Biological substance Body substance (…)

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

Root Concept:

Acute appendicitis (disorder)

The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy:

Disorder of appendix (disorder) Disorder of digestive system (disorder) Disease (disorder) Appendicitis (disorder) Disorder of digestive organ (disorder) Disorder of lower gastrointestinal tract (disorder) Disorder of digestive tract (disorder) Disorder of intestine (disorder) Finding by site (finding) Finding of large intestine (finding) Disorder of abdomen (disorder) Disorder of gastrointestinal tract (disorder) General finding of abdomen (finding) Disorder of large intestine (disorder) Disorder by body site (disorder) Disorder of trunk (disorder) Inflammatory disorder (disorder) Acute inflammatory disease (disorder) Inflammatory disorder of digestive tract (disorder) SNOMED CT Concept (SNOMED RT+CTV3) Abdominal organ finding (finding) Bowel finding (finding) Finding of appendix (finding) Finding of body region (finding) Inflammation of large intestine (disorder) Finding of trunk structure (finding) Disorder of body system (disorder) Inflammation of specific body organs (disorder) Inflammation of specific body structures or tissue (disorder) Inflammation of specific body systems (disorder) Inflammatory disorder of digestive system (disorder) Digestive system finding (finding) Gastrointestinal tract finding (finding) Disorder of body cavity (disorder) Clinical finding (finding) Viscus structure finding (finding)

Pre e Póscoordinação

 SNOMED CT proporciona síntaxe composicional para gerar expressões complexas 413350009 | finding with explicit context | : { 246090004 | associated finding | = ( 284196006 | burn of skin | : 246112005 | severity | = 24484000 | severe | , 363698007 | finding site | = 321472003 | structure of dermatoglyphic patterns of palm |) , 408729009 | finding context | = 410515003 | known present | , 408731000 | temporal context | = 410512000 | current or specified | , 408732007 | subject relationship context | = 410604004 | subject of record | }

O que SNOMED não é

 Um modelo de informação (que especifica o tipo de dados a ser coletados) para um determinado conceito clinico   Uma base de conhecimento a ser consumida por sistemas de apóio a decisão Necessariamente um sistema de codificação para uso médico

Futuro de SNOMED CT

  SNOMED CT usado como base ontológica para CID-11 (a partir de 2015) Ampliação do grupo de paises-membros (Brasil ? China?, Alemanha? França...?)   Projetos de mapeamento (ICD-0, ICF, ICPC...) Casos de uso   conexão com modelos de informação (HL7-CDA, openEHR, EN13606) codificação automatizada utilizando PLN

Recursos

         Home Page IHTSDO: www.ihtsdo.org

IHTSDO em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/IHTSDO SNOMED CT em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/SNOMED_CT Cliniclue navegador livre: http://www.cliniclue.com/ VetMed navegador web: http://viw2.vetmed.vt.edu/sct/menu.cfm

Outros navegadores: http://www.nlm.nih.gov/research/umls/Snomed/snomed_browsers.html

SNOMED e Modelos de Informação: SemanticHealthNet: http://www.semantichealthnet.eu/ SNOMED via UMLS: https://uts.nlm.nih.gov/home.html

Mais perguntas?

Contato: Stefan Schulz: [email protected]