http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1VFR from Vibrio Fischeri Выполнила Кириллова Мария ФБ0801с 1

Aliivibrio fischeri

 Bacteria;  Proteobacteria;  Gammaproteobacteria;  Vibrionales;  Vibrionaceae;  Aliivibrio.

2

 NADH:FMN-оксидоредуктаза катализирует реакцию:

NADH + FMN

→

NAD+ FMNH2



Является гомодимером, и каждый мономер связывается с FMN как с кофактором

 EC 1.6.8.1

3

NADPH FMN FMNH 2 NADP+ 4

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?Dopt=s&uid=9643 5

NAD(P)H\:FMN OXIDOREDUCTASE flavin mononucleotide http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?Dopt=s&uid=9643 6

   217 аминокислотных остатков: 48% спирали (14 спиралей; 106 остатков) 16% β-листов(8 нитей; 35 остатков) http://www.rcsb.org/pdb/explore/remediatedSequence.do?structureId=1VFR& params.annotationsStr=DSSP%2CSCOP¶ms.showJmol=false 7

FMN

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=444243 http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=444243 8

FMN

• • Computed Properties: Molecular Formula Molecular Weight C 17 H 21 N 4 O 9 P + 457.351741 [g/mol] • • • • • H-Bond Donor H-Bond Acceptor Heavy Atom Count Formal Charge Covalently-Bonded Unit Count 7 10 31 1 1 9

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1VFR 10

NADPH

http://www.brenda-enzymes.org/Mol/Mol.php4?n=14331 http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=5886 11

NADPH

• • • Computed Properties: Molecular Weight Molecular Formula 744.412943 [g/mol] C 21 H 29 N 7 O 17 P 3+ • • • • •  H-Bond Donor H-Bond Acceptor Heavy Atom Count Formal Charge Covalently-Bonded Unit Count 9 17 48 1 1 12

Где изучают

 Япония  США  Россия  Китай  Великобритания  Финляндия •Houston • Tokyo • Yokohama • Kyoto • Shizuoka, Japan • Krasnoyarsk • Moscow, Russia • Zhongxing • Athens, USA • London • Turku • College Station 13

http://gopubmed.org/web/gopubmed/1?WEB01418s2w7gmm65IiIxI0

14

                      

Кто изучает

Zenno S Saigo K Tu S Tanokura M Inouye S Lei B Jeffers C Koike H Sasaki H Koike H Hirayama S Karatani H Izuta T Maruhashi K Ishii Y Konishi J Suzuki M Van Hoek A Vetrova E Kudryasheva N Visser A Wang H Yu Y                        Tang C Nichols J Danilov V Mazhul' M Zavil'gel'skiĭ G Zarubina A Iudina Nohmi T Watanabe M Nishino T Takio K Sofuni T Kobori T Murphy M Adman E Weng S Lin J Chao Y Lee J Petushkov V Li W Parry R Nakamura H                 Kanoh H Rabin B Harbron S Eggelte H Benson S Ståhlberg T Lavi J Raunio R Baldwin T Daubner S Astorga A Leisman G Hjertén S Brolin S DeLuca M Jablonski E 15

                

Где об этом пишут

Biochemistry-us J Bacteriol Photoch Photobio Sci Arch Biochem Biophys Biochem Bioph Res Co J Biolumin Chemilumin J Biosci Bioeng Luminescence Mikrobiologiia J Biol Chem J Mol Biol Eur J Biochem J Biochem J Struct Biol Febs Lett P Natl Acad Sci Usa Mol Cell Biochem 16

Используемые базы данных

 http://www.rcsb.org/pdb  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed  http://www.gopubmed.org

17