Transcript FRET

FRET
Fluorescence Resonance Energy
Transfer
Förster Resonance Energy Transfer
시스템생물학과
2011161025 김효인
Theodor Förster
독일 물리화학자
주요 업적: FRET 
FRET에서의 Forster radius도
이 사람의 이름을 따서 붙여짐
형광(Flourescence)
photon
molecule in
ground state
photon
molecule in
excited state
light can induce transitions
between electronic states in a molecule
intersystem
crossing
S1
internal
conversion
fluorescence
absorption
the Jablonski diagram
T0
-hν
internal
conversion
+hν
S0
radiationless transition
transition involving
emission/absorption of
photon
Aragonite
Characteristic property
• Maximum excitation and
emission wavelength (nm)
• Quantum yield
• Lifetime (ps)
• Stokes shift
Stokes Shift
• Emitted fluorescent light
has a longer wavelength
and lower energy than
the absorbed light
2 common reasons
• Non-radiative decay to the lowest
vibrational level of the excited
state
• Highest vibrational level of the
ground state
FRET
488nm light
excitation
excitation
FITC
FITC
TRITC
TRITC
520nm
light
630nm
light
Energy
Donor excitation state
dipole-dipole interaction
Emission
Acceptor excitation state
ㅈ
Jablonski
diagram
• Resonance energy transfer can occur
when the donor and acceptor molecules
are less than 100 A of one another
• Energy transfer is non-radiative which
means the donor is not emitting a
photon which is absorbed by the
acceptor
• Distance dependent interaction between
the electronic excited states of two
molecules
-Donor-Acceptor의 Energy transfer는 거리에 의해 효율이 결정
(~10nm)
Calculation
∗
𝐷 ,𝐴
𝑘𝑇
→ (𝐷, 𝐴∗ )
FRET
•
𝑘 𝑇 : 특정 Donor – Acceptor 쌍 사이의 FRET 반응속도상수
𝑘 𝑇 는 또 이렇게 표현 가능한데,
𝜏𝐷 는 Acceptor가 없을 때의 Donor의
Fluorescence Lifetime을 의미함.
R은 두 분자간의 거리
𝑅0 는 𝐅𝐨𝐫𝐬𝐭𝐞𝐫 𝐫𝐚𝐝𝐢𝐮𝐬
(에너지전달효율이 50%일때의 거리)
𝑅0 는 각 분자의 Spectral
property와 dipole 방향에 의해
이러한 식으로 구할 수 있음.
• 𝜅 2 : 쌍극자의 방향 요소 ( 0~ 4)
• n : 굴절률
• J(𝜆) : 스펙트럼 중첩 적분 값
• 𝜙𝐷 : Donor의 양자수율
• Typical values of R0
Donor
Acceptor
Ro(Ǻ)
Fluorescein
55
IAEDANS
Tetramethlrhoda
mine
Fluorescein
EDANS
Dabcyl
33
Fluorescein
Fluoresscein
44
BODIPY FL
BODIPY FL
57
Fluorescein
Qsy7&Qsy9
dyes
61
46
• 𝑘 𝑇 는 하나의 FRET 쌍에 대하여 적용되는
것으로 측정할 때는 각 FRET 쌍들의 거리
와, 방향분포들이 적합하게 평균되어 나타
난다
• 실제 실험에서 FRET을 통하여 얻는 정보는
FRET 효율(E)를 측정함으로써 Donor와
Acceptor 사이의 거리를 유도해내는 것이
다.
• 𝜏𝑀 : Acceptor 분자가 있을 때 Donor 분자의 Fluorescence Lifetime
• 정류상태(Steady-state) 측정방법
• 𝐹𝐷 : 정류 상태에서
Acceptor가 없을 때
의 Donor 형광 세기
• 𝐹𝐷𝐴 : 정류 상태에서
Acceptor가 있을 때
의 Donor 형광 세기
FRET summary
• Non-radiative dipole-dipole interaction인데
dipole이 vector이기 때문에 Donor와
Acceptor의 상대적인 dipole 방향도 중요
• Emission of the donor must overlap
absorbance of the acceptor
• R<10nm
• Detect proximity of two fluorophores upon
binding
일반적인 응용
• FRET현상이 거리에 매우 dependent
->측정하고 싶은 물질에 형광물질을 달아
거리 변화를 정밀하게 측정할 수 있음.
-> 단백질의 특정 위치에 형광물질을 달아
FRET이 일어나는 정도를 측정해 두 분자간
거리를 알아내고 여러 위치에서 거리를 재
단백질의 모양을 유추할 수 있음.
일반적인 응용
• Protein 간 association을 확인할 수 있음.
ex) 항원 – 항체반응
단백질 – 효소 반응
• 추적하고 싶은 물질과 이동할 것이라 예상
되는 경로에 형광물질을 달아 물질의 이동
을 추적할 수 있음.
FRET studies of interaction and dynamics
(molecular ruler)
Association of two
biomolecules
Dynamics of
a biomolecule
학교 제도 : 교육 제도 중 학교에 관한 제도
사회적으로 가장 먼저 공인된 제도, 형식적 교육 제도
1) 서구 사회의 학교 제도
- schola : 한가, 여가를 뜻함, 오늘날의 학교 school
-고대 그리스 사회에서 지배계급의 지위와 신분을 유
지하기 위해 소수의 귀족계급을 위해 조직되어 교육
실시
-중세 유럽사회의 학교는 소수의 성직자나 지도자 양
성 을 위한 교회부속의 사원 학교가 대부분
FRET
• Biological application using FRET