Transcript Presentazione di PowerPoint

Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005
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Ruolo degli Isolatori
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LCR and insulators
 An LCR is located at the 5 end of the domain and consists of
several hypersensitive sites.
 Insulators are specialized chromatin structures that have
hypersensitive sites.
 All known insulators are able to block passage of any
activating or inactivating effects from enhancers, silencers,
or LCRs.
 In some cases, insulators have directionality, and may stop
passage of effects in one direction but not the other.
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Altri elementi del promotore di pol II
Fattori di trascrizione negli eucarioti
(trans-acting factors = fattori che agiscono in trans )
Possono essere distinti in:
- Fattori generali
- Fattori specifici (attivatori)
Complesso di inizio
su un promotore
Pol II
1 TBP +
vari TAF
-5 0
-4 0
-3 0
-2 0
TATA
TFII D
TATA
TFII A
TFII B
TFIIF
Pol II
TFII E
Pol
-1 0
1
10
20
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Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Attivazione della trascrizione
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Initiation at pol II promoters
 Binding of TFIID to the TATA box is the first step in
initiation.
 Other transcription factors bind to the complex in a
defined order, extending the length of the protected
region on DNA.
 When RNA polymerase II binds to the complex, it
initiates transcription.
Later events of pol II initiation
 TFIIE and TFIIH are required to melt DNA to allow
polymerase movement.
 Phosphorylation of the CTD may be required for
elongation to begin.
 Further phosphorylation of the CTD is required at
some promoters to end abortive initiation.
 The CTD may coordinate processing of RNA with
transcription.
Fattori di trascrizione negli eucarioti
(trans-acting factors = fattori che agiscono in trans )
Possono essere distinti in:
- Fattori generali
- Fattori specifici (attivatori)
Struttura“modulare” degli attivatori trascrizionali
• legame al DNA
• transattivazione
• dimerizzazione
• legame al ligando
Strategia per lo studio degli attivatori
Struttura degli attivatori
Scambio di domini (attivatori chimerici)
Scambio di domini
N
hGR
hER
Recettore
“chimera”
modulatore
DNA
ligando
C
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Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri
Domini di attivazione
• Domini acidici: es. GAL4
• Domini ricchi di glutammine: es. Sp1
• Domini ricchi di proline: es. CTF
Famiglie di fattori di trascrizione
• Domini a zinco
• Omeodominio (elica-giro-elica) HTH
• Elica-ansa-elica HLH
• Cerniera di leucina
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Complesso d’inizio di pol II
RNA pol II holoenzyme
 Includes pol II, GTFs, Srb/Mediator complex
 Exists in more than one form
 Can initiate transcription and respond to activators
Regolazione negativa
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Regolazione degli attivatori
Trasduzione del segnale dalla membrana al nucleo
Le vie delle MAP chinasi
Trasduzione del segnale dalla membrana al nucleo