Transcript MSBioinformatica Ago-14-2012-CNPC_final

Propuesta de Creación
Maestría en Bioinformática
Agosto de 2012
GRUPO GESTOR
Sede Bogotá:
Emiliano Barreto, IBUN
Luis Fernando Niño, Departamento de Ingeniería de Sistemas e
Industrial
Luz Mary Salazar, Departamento de Química
Edgar Reyes, Departamento de Química
Auxiliares:
Juan Felipe Ortiz
Angélica Sandoval
AGENDA
Antecedentes
Justificación
Plan de estudios
Administración
JUSTIFICACIÓN
Biotecnología: Desarrollo de tecnologías basadas en
sistemas vivos
Ciencias Biomédicas / Ing. Biomédica / Bioingeniería:
Estudio de los seres humanos y desarrollo de tecnologías
para la solución de problemas en salud
Bioinformática: conocimiento de los sistemas vivos
a través de tecnologías informáticas
CONTEXTO INTERNACIONAL
País
Programas de pregrado
Programas de posgrado
Alemania1
14
17
Reino Unido2
5
19
Estados Unidos3
4
27
Brasil4
0
2
México5
1
1
1. Koch & Fuellen, 2008 | 2. Counsell, 2002 | 3. Zatz, 2002
2. 4. Neishich, 2007 | 5. Palacios, Collado, 2007
CONTEXTO NACIONAL
Empresas e institutos con posibles campos de acción para la Bioinformática
EMPRESAS
OMISCO: empresa privada. Forma parte de Parquesoft en Cali.
INSTITUTOS
 CIAT: Centro Internacional de Agricultura Tropical
 ICA: Instituto Colombiano Agropecuario
 Cenicafé: Centro Nacional de Investigación en Café
 FIDIC: Fundación Instituto de Inmunología de Colombia
 INS: Instituto Nacional de Salud.
 CBIB: Centro de Bioinformática IBUN
 LAMFU: Laboratorio de Micología y Fitopatología de la Universidad de los Andes
 GeBiX: Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos
Centro Colombiano de Bioinformática
Centro Colombiano de Secuenciación
Centro de Investigaciones Biológicas
Instituto de Biotecnología y Agroindustria (UN Sede Manizales)
Corporación de Investigaciones Biológicas
JUSTIFICACIÓN
• Formación a nivel de Posgrado de talento humano en
bioinformática
• Generar capacidad de análisis masivo de datos biológicos
• Articulación de la investigación en bioinformática
• Implementación de infraestructura Institucional para el
almacenamiento y procesamiento de datos biológicos
• Diseño e implementación de herramientas bioinformáticas
novedosas
Programa propuesto
Maestría en Bioinformática
Profundización/Investigación
MAESTRÍA
EN BIOINFORMÁTICA
Objetivo general - Profundización.
El programa está dirigido a profesionales en ciencias de la vida, e
ingeniería o matemáticas, con interés en profundizar en el conocimiento
de las herramientas para aplicarlas en su campo de trabajo relacionando
las ciencias computacionales con la resolución de problemas de interés
biológico.
MAESTRÍA
EN BIOINFORMÁTICA
Objetivo general - Investigación.
El programa está dirigido a profesionales en ciencias de la vida, ingeniería
o matemáticas, con interés en desarrollar proyectos de investigación
interdisciplinarios para resolver problemas de interés biológico usando y
desarrollando conocimiento de las ciencias computacionales.
PROPUESTA DE
DISTRIBUCIÓN DE CRÉDITOS
INVESTIGACIÓN
PROFUNDIZACIÓN
TIPO DE ASIGNATURA
CRÉDITOS
Actividades Académicas
TIPO DE ASIGNATURA
CRÉDITOS
Actividades Académicas
Trabajo Final
Propuesta de Trabajo Final
Seminarios de profundización
10
4
6
Tesis
Proyecto de tesis
Seminario de investigación
22
4
6
Asignaturas obligatorias
Asignaturas elegibles
12
20
Asignaturas elegibles
20
Total
52
Total
52
ASIGNATURAS OFRECIDAS POR
LA UNIVERSIDAD NACIONAL
Bioestadística
Genética molecular bacteriana
Genética molecular microbiana
Ética y bioética
Sistemas inteligentes
Métodos en biología molecular
Bioensayos
Temas avanzados en sistemas de
información
Métodos estadísticos
Detección molecular de patógenos
Teoría básica de probabilidad
Métodos estadísticos genética
Epidemiologia
Biología molecular
Minería de datos
Evolución
Bioprocesos
Temas avanzados en minería de
datos I
Evolución del parasitismo y la
virulencia
Bioquímica
Modelación numérica
Farmacología molecular
Bioquímica de la acción hormonal
Modelamiento matemático
Vida artificial
Fisiologíacelular
Modelos matemáticos
Genética molecular microbiana
Fisiología y bioquímica de los
microorganismos
Teoría de estadística no
paramétrica
Inmunología
Fitomejoramiento
Teoría de la computación
Interacciones moleculares plantamicroorganismo
Genética
Teoría de modelos
Química y biotecnología fúngica
Genética cuantitativa
Teoría de probabilidad
ASIGNATURAS PROPUESTAS
Líneas de investigación
Asignaturas
Bioinformática (O)
Métodos Estadísticos en Bioinformática (O)
Biología funcional y estructural
Temas avanzados en Bioinformática
Estructural (O)
Métodos de determinación experimental de
estructuras moleculares (E)
Biología de sistemas
Tecnologías computacionales en
Bioinformática
Modelamiento de Sistemas Biológicos (E)
Programación y algoritmos en
Bioinformática (O)
Bases de datos y sistemas de información en
Bioinformática (E)
INFRAESTRUCTURA FÍSICA
Recursos Computacionales:
•
•
•
•
•
•
Salas de cómputo de la Facultad de Ingeniería
Salas de cómputo del Instituto de Biotecnología.
Clúster de la Facultad de Ingeniería
Clúster del Instituto de Biotecnología
Acceso a la malla computacional de Grid Colombia
Acceso a infraestructura computacional del European
Bioinformatics Institute (EBI)
Recursos Laboratorios de Experimentación en:
•
•
•
•
•
Facultad de Ciencias
Instituto de Biotecnología
Facultad de Medicina
Instituto de Genética
Facultad de Agronomía
GRUPOS DE INVESTIGACIÓN
Sede Bogotá
Sede MedellÍn
Métodos en Bioestadística
Grupo de Automática de la Universidad Nacional - GAUNAL
Bioquímica INS y LIBBIQ UN
Sede Caribe
Grupo de investigación en proteinas - GRIP
Modelación de ecosistemas costeros- Sede San Andres
Laboratorio de investigación en sistemas inteligentes
LISI
Sede Manizales
Algoritmos y combinatoria ALGOS-UN
Grupo de Procesamiento y Reconocimiento de Señales.
ALIFE: Grupo de investigación en vida artificial
Alimentos-Frutales
MIDAS: Grupo de investigación en minería de datos
Grupo Bioproductos
Grupo de neurociencias - Universidad Nacional
Grupo de Ambientes Inteligentes Adaptativos
Inmunología evolutiva e inmunogenética
Sede Palmira
Bioinformática IBUN
Caracterización de Recursos Zoogénicos con Fines de
Conservación y Utilización
Bioinformática Instituto de Genética
Grupo de Investigación en Diversidad Biológica
Manihot Biotec
Grupo de Investigación en Diversidad Biológica en Orquídeas y
Ecología Vegetal
Sistemática molecular y genética evolutiva
DOCENTES
Profesor
Facultad-Sede
Departamento
José Ernesto Mancera Pineda
UN, Sede Caribe
Biología
Liliana López Kleine
Facultad de Ciencias
Estadística
Edgar Reyes
Facultad de Ciencias
Química
Luis Fernando Niño
Facultad de Ingeniería
Sistemas e Industrial
Jonatan Gómez
Facultad de Ingeniería
Sistemas e Industrial
Elizabeth León
Facultad de Ingeniería
Sistemas e Industrial
Humberto Arboleda Granados
Instituto de Genética
Instituto de Genética
Luis Fernando Cadavid
Instituto de Genética
Instituto de Genética
Emiliano Barreto
Instituto de Biotecnología
Insitituo de Biotecnología
Gabriela Delgado
Facultad de Ciencias
Farmacia
Esperanza Torres
Facultad de Agronomía
Agronomía
Luz Mary Salazar Pulido
Facultad de Ciencias
Química
María Teresa Reguero
Instituto de Biotecnología
Instituto de Biotecnología
Clara Bermúdez
Facultad de Ciencias
Biología
Mary Trujillo
Facultad de Ciencias
Farmacia
Norma Angélica Valencia
Facultad de Ciencias
Farmacia