Transcript パワーポイントファイル PC演習室

化学構造を三次元で体験しよう！
生命環境科学科
• 化学構造式の作成
• 三次元可視化ソフトウェアによる立体表示
O
N
N
NH
N
NH2
HO
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H
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H
OH
OH
化学の現場で実際に利用されているソフトウエア
を使って，三次元の世界を体験してみよう！
世界で高いシェアを誇るソフト
ChemDraw
ツールを利用した化学構造式の作成
線をつないで、骨格を作る
ベンゼン環、二重結合
元素記号を加える
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NH2
ソフトウェアの連携
ChemDraw → Chem3D
• 化学構造式を線で囲む (ChemDraw)
• コピー (ChemDraw)
→ ペースト (貼り付け：Chem3D)
• 回転、モデル変更
• ３Dメガネやステレオ図による三次元可視化
いろんな構造を作ろう
Chem3D
• 単に立体にするだけでなく、構造を整えることができる
– MM2による構造最適化：理論にもとづいた計算による
• 時間があれば、タンパク質の構造をインターネットから
ダウンロードしてみよう
– 世界中の研究者が利用しているデータベース
Protein Data Bank (PDB) （日本にあるサーバ：PDBj）
津田沼のコンピュータ演
習室1には、製薬の現場
などで使われる最先端
ソフトウェアがあります !
遺伝子工学