Transcript Pubmed (versione in ppt)

PUBMED
29 novembre 2012
PUBMED
Piattaforma di accesso alla principale
banca dati bibliografica biomedica,
Medline:
• prodotta dalla U.S. National Library of Medicine
(NLM)
• sviluppata dal National Center for Biotechnology
Information (NCBI)
• accessibile gratuitamente via Web
PUBMED
Si occupa di:
–medicina
–infermieristica e discipline collaterali
–odontoiatria
–medicina veterinaria
–scienze pre-cliniche
DATI
• Indicizza oltre 5500 periodici (quasi la metà
di provenienza USA)
• La copertura è prevalentemente
anglosassone (91% dei lavori in inglese:
circa 800 periodici in altre lingue)
• Il taglio è clinico
DATI
• Inviati in maniera automatica dagli editori
[PubMed - as supplied by publisher]. Sono
compresi gli [Epub ahead of print]
• Presi in carico, ma non ancora indicizzati
[PubMed - in process]
• La citazione completata con i MeSH, le eventuali
correzioni etc etc [PubMed - indexed for
MEDLINE]
DATI
Il valore aggiunto di PubMed (e delle
banche dati in generale) è dato dal lavoro
DATI
umano di indicizzazione e normalizzazione
RISULTATI
PubMed fornisce il record bibliografico
e, quando disponibili, l’abstract e il
full-text dell’articolo recuperato.
COME ACCEDERE
PUBMED: HOME
PAGE
RICERCA LIBERA 1.
• Dopo aver inserito il termine di ricerca, il sistema
suggerisce una lista di termini a partire da quello
inserito
• Non è una lista esaustiva
• E’ diverso cercare un singolo termine o più termini
RICERCA LIBERA 2.
• Le singole parole vengono cercate, oltre che nel thesaurus
(quando ci sono) usando il campo All Fields
HYPERTENSION
ALL FIELDS
• Il campo “All Fields” comprende tutti i campi di
ricerca meno i campi “Place of Publication” e
“Transliterated Title”
• I termini fra virgolette e quelli troncati sono cercati
in questo campo
RICERCA LIBERA 3.
• Quando digitiamo più termini nella stringa di
ricerca, PubMed attiva l’Automatic Term
Mapping
• Tabelle di conversione
– Mesh
– Titolo della rivista
– Autore/Collaboratore
RICERCA LIBERA. 4
• Quando i termini sono trovati all’interno di una
delle tabelle, la ricerca si ferma
• Se i termini non vengono trovati in una tabella,
vengono ricercati in AND allargando molto
la ricerca (v. Search details)
ESEMPIO
Knee surgery
FRASE ESATTA
• Usare le virgolette per trovare una frase “così come
è scritta” (es. “knee surgery”, “molecular biology” o “metabolite
reproduction”)
• Usare il troncamento (es. knee surger*)
TRONCAMENTO
• L’asterisco * sostituisce zero o più caratteri
• Alla fine della parola: trova i termini con la stessa
radice
• Esclude l’Automatic Term Mapping quindi non
vengono ricercati nei Mesh
• Non si applica alle stopword
– Parole che non vengono cercate
• a, an, are, be, for...
FRASE ESATTA: ESEMPIO
STRUMENTI PER LA
RICERCA:
Il thesaurus - MESH
• Vocabolario controllato
dei descrittori (sinonimi,
acronimi e varianti di lingua
vengono normalizzati con un
unico termine)
• Strutturato ad albero
STRUMENTI PER LA
RICERCA:
Il thesaurus - MESH
La strategia di ricerca può avvantaggiarsi delle
seguenti opzioni:
• Major topic (termine principale)
• Esplosione o NON esplosione del termine
• Uso dei Sotto descrittori
STRUMENTI PER LA
RICERCA:
Il thesaurus - MESH
• Vantaggi:
– I sinonimi sono inclusi nella ricerca
– Gli articoli trovati sono pertinenti
I SOTTODESCRITTORI:
Mesh subheadings
• Ad ogni termine del thesaurus corrispondono solo
i subheadings che lo riguardano
• Riducono il numero di record recuperati secondo
l’intenzione di chi ricerca
STRUMENTI PER LA
RICERCA:
Il thesaurus
• Quando ricercare nel thesaurus:
– Argomento consolidato (v. tempi di attribuzione dei
descrittori)
– I sinonimi sono inclusi nella ricerca
– Gli articoli trovati sono pertinenti
• E’ sempre consigliato fare anche la ricerca
libera
RICERCA PER
DESCRITTORI 1:
Mesh database
RICERCA PER
DESCRITTORI 2:
Mesh database
RICERCA PER
DESCRITTORI 3.
RICERCA PER
DESCRITTORI 4.
– Subheadings
– Major topic
– Explosion
– Entry terms (sinonimi)
– Ricercare tramite Search builder
PAUSA
CONSIGLIO
• Cercare un termine alla volta
• Unire i termini tra loro con gli operatori booleani
OPERATORI BOOLEANI
• AND
• OR
• NOT
ESECUZIONE DEI BOOLEANI 1.
• Il primo operatore da sinistra è eseguito per primo
– influenza AND vaccine OR vaccination
• articoli che contengono sia "influenza" sia "vaccine"
• articoli con "vaccination"
ESECUZIONE DEI BOOLEANI 2.
• Le parentesi modificano l’ordine di ricerca: i
termini fra parentesi sono eseguiti per primi e poi
combinati con gli altri
– influenza AND (vaccine OR vaccination)
• “influenza” e “vaccine”
• “influenza” e “vaccination”
COMBINARE I PASSI
DELLA RICERCA
AMPLIARE LA
RICERCA:
Related citations
LIMITARE LA RICERCA
LIMITARE LA RICERCA:
Clinical Queries
LIMITARE LA RICERCA:
Clinical Queries
VISUALIZZARE I RISULTATI
FORMATO ABSTRACT
con link al full text e a
TROVAMI
SCARICARE LA VERSIONE ELETTRONICA
SALVARE I RISULTATI
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• La Clipboard è un luogo nel quale posso
temporaneamente collocare i miei risultati
• Elimina automaticamente i duplicati
• Nella clipboard posso fare le stesse operazioni
consentite nella Main Search Page
SALVARE I RISULTATI:
la clipboard
• Contiene fino a un massimo di 500 record
• Dal momento in cui smetto di lavorare, resta
disponibile per 8 ore
CITATION SENSOR
•
•
Cerca le citazioni bibliografiche a partire dai termini inseriti in libera
Gli articoli trovati dal Citation sensor sono evidenziati
in testa alla lista dei risultati
– Smith 2009
GENE SENSOR
•
Gene Sensor riconosce i circa 5mln di geni del database Gene; se ne
individua uno nella stringa di ricerca, offre, in un riquadro primo fra i
risultati, link a informazioni specifiche in Gene database
– a2m liver
SINGLE CITATION MATCHER
• Per completare
citazioni parziali
• Si può compilare
anche un solo campo
MY NCBI
REGISTRAZIONE
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