Transcript enquête
Initiation à la recherche clinique et
épidémiologique
(Les différents types d’enquête)
Initiation à l’analyse de données
(Comment présenter les données ?)
(Pourquoi a-t-on besoin des tests ?)
Dr Benoît Lepage ([email protected]), Dr Vanina Bongard ([email protected])
Département d’Epidémiologie, Economie de la Santé et Santé Publique
Université Toulouse III – Paul Sabatier
Master de Santé Publique, Toulouse III
I)
Les outils statistiques
- Description de données
- Sondages, échantillons, inférence
- Estimations
- Tests
II) Les principaux types d’enquêtes
- Essais cliniques
- transversales
- Cohortes
- Cas témoins
I. Outils statistiques
Comment présenter les données ?
• Unités statistiques : éléments faisant l’objet de l’étude :
personnes, temps de mesures, département, …
• Variables statistiques :
Paramètre pouvant prendre différentes valeurs d’une
unité statistique à l’autre
• variable qualitative = variable catégorielle
– variable qualitative nominale (sans relation d’ordre)
– variable qualitative ordonnée (relation d’ordre)
• Variable quantitative
– variable quantitative discontinue = discrète
– variable quantitative continue
a. Représentation synthétique d’une
variable qualitative
• Tableaux de fréquence
Variable
booléenne,
dichotomique,
binaire, à 2
modalités
• Fréquence absolue : nombre de cas
• Fréquence relative : pourcentage
N = 150
Sexe, n (%)
hommes
femmes
Tabagisme, n (%)
non fumeurs
anciens fumeurs
fumeurs
80 (53,3 %)
70 (46,7 %)
77 (51,3 %)
28 (18,7 %)
45 (30,0 %)
Graphiques => faire ressortir une vision synthétique
(mais souvent moins précise que les tableaux)
• Diagrammes en secteurs
Distribution des sérodiagnostics de la toxoplasmose
dans un laboratoire en fonction du type de patient
(CAMEMBERT)
Nouveaux-nés
20%
Sida
6%
Suspicion clinique
4%
Femmes enceintes
70%
• Diagrammes en barres
Distribution de la profession (diagramme en barres)
frequence
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
Nurse
Physician
Resp
therapist
Occup
therapist
profession
Physio
therapist
Psychologist
Other
b. De la variable qualitative à la
variable quantitative
• Histogrammes (variables discrètes)
Distribution du nombre d'enfants par
femme dans l'échantillon
35
30
25
Pourcentage
20
15
10
5
0
0
1
2
3
Nombre d'enfants
4
5
• Histogrammes
Distribution de la pression artérielle
systolique dans l'échantillon
35
30
25
Nombre de
cas
20
15
10
5
0
70 80
90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190
Pression artérielle systolique
(mm Hg)
• Courbes de distribution
Distribution de la pression artérielle
systolique dans l'échantillon
40
Nombre de30
cas
20
10
0
70
90
110
130
140
160
Pression artérielle systolique
(mm Hg)
c. Représentation synthétique d’une
variable quantitative
• 1. Paramètres de position ou de tendance centrale
– moyenne arithmétique et géométrique
– médiane
– mode
• 2. Paramètres de dispersion
– variance
– écart type, erreur standard
– quantiles
– intervalle interquartile
– Extrêmes, étendue
DISPERSION
POSITION
N
1. Paramètres de position
Moyenne arithmétique
Nb de
cas
m
x
i 1
i
N
Nb de
cas
80
35
70
30
60
25
50
20
40
15
30
10
20
10
5
0
0
Distribution gaussienne:
Distribution non gaussienne:
La moyenne correspond aux valeurs
les plus fréquentes
La moyenne ne correspond pas aux
valeurs les plus fréquentes
bon indicateur de tendance
centrale
mauvais indicateur de tendance
centrale
1. Paramètres de position
• Médiane : plus adaptée si distribution asymétrique
• Valeur centrale séparant l’échantillon en deux moitiés
• 50 % des valeurs sont au dessus
• 50 % des valeurs sont en dessous
• rang de la médiane :
• (n + 1) / 2 si n est pair
• n/2 si n est impair
• Mode
• Valeur la plus représentée (variables quantitatives discrètes +)
Exemple médiane (1)
Poids en Kg d’une série de 80 sujets
(après classement par ordre croissant)
45
70
74
77
50
70
74
78
55
71
74
79
58
71
74
79
60
71
74
79
63
71
74
79
64
72
74
80
64
72
74
80
65
72
74
80
66
72
75
80
67
73
75
80
67
73
75
81
67
73
75
81
67
73
76
81
68
73
76
82
68
73
76
82
68
73
76
83
Moyenne de la 40ème et 41ème valeur
Médiane = (73+74)/2 = 73,5 kg
(ne nécessite pas de connaître toutes les
valeurs)
68
73
77
84
68
73
77
84
68
73
77
86
Exemple médiane (2)
•
Une série de 7 sujets :
45 50 55 58 60 63 64
Ici, n est impair, la médiane est la valeur
de rang (n+1)/2
= la valeur de rang 4
La médiane est 58
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
Dispersion
1
0,9
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
• Variance
n
1
2
=
n
(X i - )
2
i=1
• La variance est la moyenne des carrés des écarts des valeurs par
rapport à la moyenne.
• L’unité de la variance est l’unité de la variable étudiée au carré.
• Ecart Type, déviation standard, SD
=2
• L’unité de l’écart type est identique à l’unité de la variable étudiée.
Si une variable suit
une distribution
normale :
- 2DS
- 1DS
+ 1DS
68%
95%
Moy ± 1ET contient 68% des observations
Moy ± 2ET contient 95% des observations
Moy ± 3ET contient 99% des observations
+ 2DS
• Quantiles
• (k – 1) valeurs séparant l’échantillon en k zones comportant le
même nombre d’observations
• k = 3 : tertiles
• k = 4 : quartiles
• k = 10 : déciles
• k = 100 : centiles ou percentiles
• Un intervalle entre deux quantiles correspond à un intervalle
interquantile
Exemple : quartiles
Poids en Kg d’une série de 80 sujets (après
classement par ordre croissant)
45
70
74
77
50
70
74
78
55
71
74
79
58
71
74
79
60
71
74
79
1er quartile
63
71
74
79
64
72
74
80
64
72
74
80
65
72
74
80
66
72
75
80
= (¼,¾)
67
73
75
80
67
73
75
81
67
73
75
81
67
73
76
81
68
73
76
82
= 69 kg
2ème quartile = Médiane
= 73,5 kg
3ème quartile = (¾,¼)
= 77 kg
68
73
76
82
68
73
76
83
68
73
77
84
68
73
77
84
68
73
77
86
Notion d’inférence = tirer une conclusion au niveau
d’une population inaccessible
à partir d’observations faites sur un échantillon
• Population cible : ensemble des individus auxquels on
s’intéresse
• Population source : ensemble des individus à partir
desquels on effectue le tirage au sort
• Echantillon : ensemble des individus effectivement
étudiés
Un sondage est un procédé qui consiste à
n’observer qu’une partie de la population étudiée
(échantillon) et à tirer de cette observation des
informations sur la population entière.
Population source représentative
de la population cible
N sujets
Echantillon
n sujets
n<N
Fluctuations d’échantillonnage
Malade
Non malade
AVANTAGES d’un sondage :
Le sondage est plus rapide, moins cher et plus facilement réalisable
qu’une enquête exhaustive sur la population cible.
INCONVENIENT d’un sondage :
Incertitude de l’extrapolation à la population cible des observations
faites sur l’échantillon.
CONTRAINTES d’un sondage :
L’échantillon doit être représentatif de la population cible.
L’échantillon doit être composé d’unités statistiques en nombre
suffisant.
Il faut bien
distinguer un biais des fluctuations normales
d’échantillonnage
erreur systématique
Estimation
biaisée
erreur aléatoire
Conduit à définir un
intervalle de confiance
du paramètre à estimer
Biais et erreurs aléatoires
Déformation des faits due au
hasard de l’échantillonnage :
erreur non systématique
due au hasard
(fluctuations
d’échantillonnage )
Estimation précise et
non biaisée
Estimation peu précise
mais non biaisée
Déformation des faits due à
un biais :
erreur systématique allant
toujours dans le même
sens (biais)
Estimation précise
mais biaisée
Estimation peu précise
et biaisée
Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une
population à partir des paramètres
observés sur un échantillon
Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une
population à partir des paramètres
observés sur un échantillon
1.
Valeur observée valeur
inconnue de la population
Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une
population à partir des paramètres
observés sur un échantillon
1.
Valeur observée valeur
inconnue de la population
2.
Valeur observée proche
de la valeur inconnue si
échantillon représentatif
Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une
population à partir des paramètres
observés sur un échantillon
1.
Valeur observée valeur
inconnue de la population
2.
Valeur observée proche
de la valeur inconnue si
échantillon représentatif
3.
En répétant l’échantillonnage,
autres valeurs proches les unes
des autres
Estimation : Définition (2)
Valeur observée (échantillon) Valeur exacte (population générale)
• Incapable de connaître la vraie valeur !!!
• Objectif de l’estimation en statistique =>
calculer des bornes où se trouve la
valeur inconnue du paramètre (avec
une confiance suffisamment grande)
= Intervalle de confiance +++
Estimation d’une moyenne inconnue
(1)
• On sait calculer la moyenne observée d’une
variable quantitative sur un échantillon
• Problème: Estimer la moyenne inconnue de
la population d’où est extrait l’échantillon
Estimation d’une moyenne inconnue
(2)
• Utiliser un échantillon représentatif de la
population (obtenu par tirage aléatoire)
• Estimation de à partir de l ’échantillon 1 :
– est estimée par m1 = (xi) / n1
– où xi = {x1, x2, … , xn1} les n1 valeurs de X dans
l ’échantillon 1
– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
Estimation d’une moyenne inconnue
(2)
• Échantillon représentatif de la population
(obtenu par tirage aléatoire)
– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 2ème échantillon (par tirage aléatoire)
– m2 proche de m1
– m2 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
Estimation d’une moyenne inconnue
(2)
• Échantillon représentatif de la population
(obtenu par tirage aléatoire)
– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 2ème échantillon (par tirage aléatoire)
– m2 proche de m1
– m2 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 3ème échantillon : idem...
Estimation d’une moyenne inconnue
(3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons
possibles tirés de la population générale
Estimation d’une moyenne inconnue
(3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons
possibles tirés de la population générale
• On obtiendrait une moyenne m pour chaque
échantillon
Estimation d’une moyenne inconnue
(3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons
possibles tirés de la population générale
• On obtiendrait une moyenne m pour chaque
échantillon
Fluctuations
d’échantillonnage de la
moyenne
Estimation d’une moyenne inconnue
(3)
• L’estimation m de la moyenne inconnue
est une variable aléatoire puisqu’elle varie
d’un échantillon à l’autre
Distribution
de la variable X
dans la
population
Fluctuations
d’échantillonnage de
l’estimation de la
moyenne
Distribution
des moyennes
de X dans
chaque
échantillon
Estimation d’une moyenne inconnue
(3)
• L’estimation m de la moyenne inconnue
est une variable aléatoire puisqu’elle varie
d’un échantillon à l’autre
On peut estimer la moyenne
de l’estimation de la moyenne
Distribution
de la variable X
dans la
population
Et la variance de l’estimation
de la moyenne
Estimation d’une moyenne inconnue
Dans un échantillon,
(4)
on sait calculer un
intervalle de confiance
à 95%
m1
m2
m3
m4
m5
m6
m7
m8
m9
…
mk
Moyenne
de la population
Si on calcule
l’intervalle
de confiance auprès
d’un très grand
nombre
d’échantillons,
la vraie moyenne
de
la population est
comprise dans 95 %
des intervalles de
confiance
Intérêt des tests
•
Les tests servent à extrapoler les résultats
observés sur des échantillons à l’ensemble
des populations dont ils sont issus +++
–
•
Échantillon : image ponctuelle
Intérêt majeur des tests :
–
–
Économie de moyens +++
En permettant de déceler des différences sur un
nombre réduit d’observations
Principe des tests de comparaison
• Principe général : Regarder si la différence
qu’on observe dans un échantillon est due au
hasard ou si au contraire cette différence est
telle qu’il est fort peu probable de l’observer par
hasard
• 2 hypothèses sont posées :
– Hypothèse nulle = « il n’y a pas de différence »
– Hypothèse alternative = « il y a une différence »
(dans la population à laquelle on veut généraliser le
résultat)
Principe des tests de comparaison
•
Illustration : vous pariez à pile ou face avec
un ami, il vous tend une pièce.
–
Hypothèse nulle H0 : la pièce n’est pas faussée, et
j’ai une chance sur deux de gagner
P(joueur 1 gagne) = P(joueur 2 gagne)
–
Hypothèse alternative H1 : la pièce est faussée, un
des joueurs à une probabilité plus élevée de
gagner que l’autre joueur :
P(joueur 1 gagne) P(joueur 2 gagne)
Principe des tests de comparaison
•
Illustration : vous pariez à pile ou face avec
un ami, il vous tend une pièce.
–
Au premier essai, vous perdez
Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette
fois ci, vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle
selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous
acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la
mise.
Principe des tests de comparaison
•
Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il
vous tend une pièce.
–
Au premier essai, vous perdez
–
Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette fois ci,
vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle
la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une
partie en espérant rattraper la mise.
Au deuxième essai, vous perdez à nouveau
Vous pensez que vous n’avez vraiment pas de chance, vous ne
remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce
n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en
espérant rattraper la mise.
Principe des tests de comparaison
•
Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il
vous tend une pièce.
–
Au premier essai, vous perdez
–
Au deuxième essai, vous perdez à nouveau
–
Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette fois ci,
vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle
la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une
partie en espérant rattraper la mise.
Vous pensez que vous n’avez vraiment pas de chance, vous ne
remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce
n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en
espérant rattraper la mise.
Vous continuez à jouer, vous perdez 5 fois de suite.
Vous commencez à avoir de sérieux doute et à remettre en
cause la validité de l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce
n’est pas faussée
Principe des tests de comparaison
•
Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il
vous tend une pièce.
–
Au bout du 10ème essai, vous avez perdu 10 fois de suite,
vous décider d’arrêter de jouer,
la probabilité que la pièce ne soit pas faussée
(que l’hypothèse nulle soit vraie) est trop faible : vous
rejetez cette hypothèse et acceptez l’hypothèse
alternative H1 (la pièce est faussée)
vous prenez le risque de vous fâcher avec votre ami (le
risque de se fâcher alors que la pièce était en réalité
normale est devenu beaucoup trop faible).
Il y a un seuil à partir duquel, on décide de rejeter
l’hypothèse nulle
Exemple d’utilisation d’un test
Principe général des tests de comparaison : Regarder
si la différence qu’on observe dans un échantillon est
due au hasard ou si au contraire cette différence est
telle qu’il est fort peu probable de l’observer par
hasard
2éme Exemple :
La prévalence du diabète est-elle supérieure chez les sujets
en surcharge pondérale par rapport aux sujets de poids
normal ?
Sondage dans la population cible pour obtenir un
échantillon représentatif.
Hypothèse nulle H0 :
La prévalence du diabète dans la population cible est
identique parmi les sujets de poids normal et parmi les
sujets en surcharge pondérale.
P1 = P0
ou
D = P1 – P0 = 0
Hypothèse alternative H1 :
La prévalence du diabète dans la population cible est
différente parmi les sujets de poids normal et parmi les
sujets en surcharge pondérale.
P1 P0
ou
D = P1 – P0 0
Si l’échantillon est de taille suffisante et représentatif :
- sous H0 : d = p1 – p0 devrait être petite
- sous H1 : d = p1 – p0 devrait être grande
On réalise un test statistique pour savoir si d peut
être considérée comme grande (significativement
différente de 0).
Autrement dit on réalise un test statistique pour
savoir s’il est vraisemblable de rejeter l’hypothèse
nulle.
Population cible
d petite
absence de
différence
existence d’une
différence
D=0
D0
Conclusion vraie
Conclusion fausse
échantillon
d grande
Conclusion fausse
Conclusion vraie
Il y a toujours un risque de se tromper dans notre
conclusion => risque d’erreur
Risque de première espèce ( seuil de significative p) :
Probabilité de rejeter à tort l’hypothèse nulle (probabilité de
conclure à tord à l’existence d’une différence entre les
groupes).
Risque de seconde espèce :
Probabilité de conserver à tort l’hypothèse nulle (probabilité
de conclure à tord à l’absence de différence entre les
groupes).
Puissance du test :
Probabilité de mettre en évidence une différence qui existe
vraiment entre les groupes : Puissance = 1 -
Le classement en « d petite »
ou « d grande » se fait à partir
de la p-value (degré de signification)
du test :
Si p < , on considère que d est
petite
échantillon
Population cible
absence de
différence
existence d’une
différence
D=0
D0
d petite
Conclusion vraie
Conclusion fausse
test non
significatif
1-
d grande
Conclusion fausse
Conclusion vraie
test significatif
1-
Un test significatif permet de conclure à l’existence d’une différence.
Un test non significatif ne permet pas d’exclure l’existence d’une
différence.
II. Principaux types d’enquêtes
Une enquête est une opération qui consiste à recueillir de
l’information, puis à l’analyser en vue de résoudre une ou
plusieurs questions spécifiée(s) à l’avance.
Enquêtes exhaustives (sur l’ensemble de la population)
Enquête sur échantillon (obtenu par sondage)
Principaux types d’enquêtes
Enquêtes
d’observation
L’exposition n’est pas contrôlée
par l’investigateur
Enquêtes
expérimentales
L’exposition est contrôlée
par l’investigateur
descriptives
analytiques
enquêtes transversales
cohortes non comparatives
enquêtes transversales
enquêtes cas - témoins
enquêtes de cohorte
(« exposés - non exposés »
ou « longitudinale »)
randomisées essais cliniques phase III
non
randomisées
essais cliniques phase I et II
enquêtes avant - après
Principaux types d’enquêtes
Essais cliniques
La vie du médicament
découverte d’une molécule
études pré-cliniques (animal)
phase I (volontaires sain)
phase II (volontaires malades)
phase III (volontaires malades : essais comparatifs)
Autorisation de Mise sur le Marché (A.M.M.)
Phase IV
(pharmacovigilance, pharmaco-épidémiologie,
pharmaco-économie)
pharmacologie
clinique
Principaux types d’enquêtes
Essais cliniques
Essais non randomisés :
- Phase I : étude de la première administration chez l’homme
- volontaires sains,
- évaluation des effets indésirables => sécurité
- et effets pharmacodynamiques
-Phase II : étude de l’efficacité pharmacologique
- volontaires malades
- pharmacologie (posologie efficace, dose-effet)
- pharmacocinétique
Principaux types d’enquêtes
Principes méthodologiques des essais de phase III
Objectif : évaluer l’efficacité thérapeutique d’une intervention
1. principe de comparaison
par rapport à un placebo
ou par rapport à un médicament de référence
indispensable
pour
distinguer
l’efficacité
médicament de l’évolution naturelle de la maladie
du
Principaux types d’enquêtes
Principes méthodologiques des essais de phase III
2. principe du tirage au sort (randomisation)
La répartition des sujets dans chaque groupe se fait par
tirage au sort.
indispensable pour assurer la comparabilité des deux
groupes
les groupes sont comparables en tout point, sauf pour
l’attribution du traitement
Principaux types d’enquêtes
Principes méthodologiques des essais de phase III
3. principe du double aveugle
Le patient ne sait pas s’il prend le placebo ou le traitement
testé.
Le médecin ne le sait pas non plus.
indispensable pour maintenir la comparabilité des
groupes au cours de l’étude
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation transversale
Souvent : un échantillon représentatif d’une population
et n’est pas sélectionné en fonction de l’exposition
ou de la maladie
Exposition ?
temps
Maladie ?
Au moment de l’enquête, on recueille au même moment
les informations sur la présence d’une exposition et la
présence d’une maladie
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation transversale
Estimation de la prévalence d’une maladie
Proportion de sujets atteints d’une maladie dans une
population à un instant donné t.
P=
M
M+N
P : prévalence de la maladie dans la population à l’instant t
M : nombre de malades dans la population à l’instant t
N : nombre de non malades dans la population à l’instant t
effectif total de
la population à
l’instant t
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale
= Enquête de cohorte
Les sujets sont suivis dans le temps
(on connaît les dates des évènements mesurés)
Exposition ?
temps
Maladie ?
Début d’étude :
Recueil prospectif
Début d’étude :
Recueil rétrospectif (cohorte « historique »)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale
= Enquête de cohorte
Parfois l’inclusion des sujets au départ se fait en fonction d’une
exposition dichotomique : enquête « exposé – non exposé »
Exposition ?
temps
Maladie ?
Début d’étude :
Recueil prospectif
Début d’étude :
Recueil rétrospectif (cohorte « historique »)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale
= Enquête de cohorte
On peut estimer l’incidence d’une maladie
Vitesse moyenne de production de nouveaux cas d’une
maladie dans une population pendant un intervalle de
temps [t; t+t].
nombre de nouveaux cas sur [t; t+ t]
TI =
effectif moyen des sujets à risque sur [t; t+ t]
TI : taux d’incidence de la maladie dans la population pendant [t; t+ t]
Nt + Nt+ t
Effectif moyen des sujets à risque sur [t; t+ t] :
2
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale
= Enquête de cohorte
On peut calculer le risque relatif (RR) : comparer les taux
d’incidence entre différentes expositions
Le risque relatif d’une exposition (par rapport à l’absence
d’exposition) :
RR
incidenceexposés
incidencenon exposé
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale
= Enquête de cohorte
On peut calculer le risque relatif (RR) : comparer les taux
d’incidence entre différentes expositions
- Si RR > 1 : le risque de maladie est augmenté chez les
sujets exposés
- Si RR < 1 : le risque de maladie est diminué chez les
sujets exposés
- Si RR=1 : le risque de maladie est le même chez les
sujets exposés et non-exposés
Principaux types d’enquêtes
Exemple dans une enquête exposés – non exposés,
avec la même durée de suivi pour tout le monde :
exposés
% de malades ?
étude exposés non exposés
non
exposés
% de malades ?
Principaux types d’enquêtes
Exemple dans une enquête exposés – non exposés,
avec la même durée de suivi pour tout le monde :
Estimation d’un risque relatif de maladie
malades
non malades
exposés
a
b
n1
non exposés
c
d
n0
m1
m0
RR = Re / Rne = Ie / Ine = (a/n1) / (c/n0)
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
On va comparer la fréquence de l’exposition antérieure
chez des malades (cas) et des non-malades (témoins)
Recueil rétrospectif de la présence
d’une exposition antérieure
Début d’étude :
Sélection des malades
et témoins
Exposition ?
temps
Maladie ?
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
cas
=
malades
% d’exposés ?
étude cas - témoins
% d’exposés ?
témoins
=
sains
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
Dans une enquête de cohorte ou une enquête transversale, la sélection
ne dépend pas de la présence de la maladie :
Les exposés et non-exposés dans l’échantillon sont représentatifs des
exposés et non-exposés de la population
on peut estimer le risque d’être malade chez les exposés et non
exposés et calculer un risque relatif
Dans une enquête cas témoins le pourcentage de malades est choisi
arbitrairement par l’investigateur :
on ne peut pas estimer le risque dans la population ni le risque relatif,
il faut calculer un odds ratio (OR) = rapport de cote
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
Estimation d’un odds ratio de maladie
OR = [e1/(1-e1)] / [e0/(1-e0)] = ad / bc
avec e1 et e0 fréquences de l’exposition chez les
malades et les non malades :
malades non malades
OR = [Re/(1-Re)] / [Rne/(1-Rne)]
exposés
a
b
n1
non exposés
c
d
n0
m1
m0
Indispensable ++++
Avant la mise en place d’une étude : quelque soit le schéma
Toujours commencer par l’écriture du protocole d’étude :
- Contexte
- hypothèses à évaluer
- l’objectif précis
- les méthodes à mettre en œuvre :
- population (critères d’inclusion, d’exclusion)
- critères de jugement
- variables d’exposition
- autres variables à prendre en compte
- méthodes de mesures des différentes variables
- calcul de l’effectif nécessaire pour répondre à l’objectif
- méthodes statistiques envisagées
Dernier point important pour les sciences de la vie :
la notion de variabilité
•
Prendre en compte la variabilité +++
– Variabilité biologique (entre-sujet et
intra-sujet)
– Variabilité instrumentale (expérimentale,
liée à l’instrument lui-même)
variabilité biologique inter-sujet
+ variabilité biologique intra-sujet
+ variabilité instrumentale
+ variabilité inter- et intra-examinateur
…_____________________________
= Variabilité totale
Variabilité : exemples
• Variabilité biologique inter-individuelle
– Durée de la gestation, taille à l’âge adulte, poids
de naissance
• Variabilité biologique intra-individuelle
– Cortisol, glycémie, urée, tension artérielle
• Variabilité liée à la méthode de mesure
– TA chez l’obèse, mesure sur une échographie
(liée à l’appareil et au clinicien)
• Variabilité liée à l’expérimentation
– Effet centre, effet placebo, environnement
Variabilité : conséquences
• Rechercher une différence :
Facile de montrer une
différence entre les deux
moyennes
Difficile de montrer une
différence entre les deux
moyennes
• Rechercher une corrélation :
Facile de montrer
une
corrélation entre les
deux
variables
Difficile de montrer
une
corrélation entre les
deux
variables