Transcript Guinée - Missions

CAPITALISATION DES EXPERIENCES SOUS-REGIONALES DE LUTTE CONTRE LE CHOLERA
POUR L’ELABORATION D’UN GUIDE PRATIQUE DE PREPARATION ET DE REPONSE AUX EPIDEMIES
DAKAR – AVRIL 2010
Mise en œuvre et usages de l’outil de cartographie :
intérêts et limites pour la lutte contre le choléra
l’exemple de la République de Guinée (2009-2010)
Implementation and use of cartography tools :
Avantages and limits for the fight against cholera as used in Guinea (2009-2010)
Dabiss
Sansalé
Koundara
Sangarédi
Tanéné (B)
Mali
Kanfarandé
Boké-Centre
Koubia
Gaoual
Kolaboui
Lélouma
Malapouyah
Kam sar
Bintim odia
Colia
Tougué
Siguiri
Dinguiraye
Labé
Boké
Mankountan
Pita
Télimélé
Dalaba
Mandiana
Dabola
Lisso
Tougnifili
Mamou
Fria
Kouroussa
Boffa
Douprou
Boffa-Centre
Dubréka
Coyah
Koba (B)
Kankan
Kindia
Faranah
Conakry
Forécariah
Kissidougou
Kerouané
Beyla
Geckedou
Macenta
Lola
N'Zerekoré
Yomou
7 avril 2010
UMR CNRS 6249
Div. Prévention et Lutte contre la Maladie
Ministère de la Santé et de l’Hygiène Publique
République de Guinée
1.1 Présentation des outils /contexte
Overview of tools/context
Guinée : façade littorale & Contrastes géographiques
Coast and geographic profil & contrasted climats
! en Afrique de l’ouest côtière, Guinée = un « élément
cartographique » côtier …
Un ensemble complexe affecté par le choléra
(Guinea is only one element in a complex sub-regional cholera
epidemiology)
0
cas
10000 20000 30000
Sénégal
SENEGAL
1970
1980
1990
2000
2010
2000
2010
2000
2010
2000
2010
2000
2010
2000
2010
année
Graphs by country_num
0
MALI
2000 cas 4000
6000
Mali
1970
1980
1990
année
Graphs by country_num
2000 cas 4000
6000
Cote d'Ivoire
0
COTE D’IVOIRE
1970
1980
1990
année
Graphs by country_num
cas
10000 20000 30000 40000
Liberia
0
LIBERIA
1970
1980
1990
année
Graphs by country_num
0
S.LEONE
cas
5000
10000
Sierra Leone
1970
1980
1990
année
Graphs by country_num
0
cas
10000 20000 30000
Guinée
GUINEE
1970
1980
1990
année
Graphs by country_num
20000
30000
Guinée-bissau
0
10000
cas
GUINEE-BISSAU
1970
1980
1990
2000
2010
2000
2010
année
Graphs by country_num
1970
WORLD HEALTH ORGANIZATION Global Task Force on Cholera Control [CHOLERA COUNTRY PROFILE (2010)]
1980
1990
Données : Week. Epi. Record - OMS (=> 2007).
Guinée Bissau
1.2 Présentation des outils /contexte
General presentation of tools/context
Pays / Régions (n=5) / Préfectures (n=38) / Sous-préfectures (n > 300)
En zone urbaine : Quartiers / secteurs
(urban settings : quarters, sectors)
Nécessité d’analyse à des échelles complémentaires (temps et espace)
A clear need of complementary studies with different scales of time and space
Koundara
Mali
Koubia
Gaoual
Lélouma
Tougué
Siguiri
Dinguiraye
Labé
Boké
Pita
Télimélé
Dalaba
Mandiana
Dabola
Mamou
Fria
Kouroussa
Boffa
Dubréka
Kankan
Kindia
Coyah
Faranah
Conakry
Forécariah
Kissidougou
Kerouané
Beyla
Geckedou
Macenta
Lola
N'Zerekoré
Yomou
Préfectures (n=38)
Répartition de la maladie
Découpage préfectoral
Geographic pattern of cholera
(prefectoral scale)
Taux d’incidence
cumulée pour 10 000
hab.
Répartition de la maladie
Découpage préfectoral
Geographic pattern of cholera
(prefectoral scale)
Profondeur
temporelle suffisante pour dégager
les caractéristiques épidémiologiques.
We need a longer temporal period
in order to obtain a better understanding
of cholera epidemiological characteristics
Les principaux problèmes :
(Main difficulties)
 Archivage
(records)
 Accessibilité des données
« papier »
(availability of registers under paper
format)
 Sous-notification/complétude
interne
(Under notification and internal
quality of recorded data)
Taux d’incidence
cumulée pour 10 000
hab.
Un exemple de changement d’échelle :
Focus sous-préfectoral
Pref. de Boke et Boffa
2005
2007
N
Geographic pattern of cholera
(sub-prefectoral scale)
Boke and Boffa
Dabiss
Sansalé
Dabiss
Sansalé
Sangarédi
Sangarédi
Tanéné (B)
Tanéné (B)
Boké-Centre
Kanfarandé
Kanfarandé
Kolaboui
Boké-Centre
Kolaboui
Malapouyah
Kam sar
Malapouyah
Kam sar
Bintim odia
Colia
Mankountan
Bintim odia
Colia
Mankountan
Lisso
Lisso
Tougnifili
Tougnifili
Douprou
Douprou
Boffa-Centre
Boffa-Centre
Koba (B)
2006
Koba (B)
2008
Dabiss
Sansalé
Dabiss
Sansalé
Sangarédi
10 to 100
5 to 10
1 to 5
0,1 to 1
0 to 0,1
(4)
(2)
(2)
(1)
(9)
Kanfarandé
Tanéné (B)
Boké-Centre
Kanfarandé
Kolaboui
Malapouyah
Kam sar
Boké-Centre
Kolaboui
Bintim odia
Malapouyah
Kam sar
Colia
Mankountan
Bintim odia
Colia
Mankountan
boke_boffa_TA by TA_2006
Lisso
Tougnifili
0,1 to 1
(1)
0 to 0,1 (17)
Sangarédi
Tanéné (B)
boke_boffa_TA by TA_2005
Lisso
Tougnifili
Douprou
Douprou
Boffa-Centre
Boffa-Centre
60 km
boke_boffa_TA by TA_2007
10 to 100
5 to 10
1 to 5
0,1 to 1
0 to 0,1
(2)
(2)
(6)
(2)
(6)
Koba (B)
Koba (B)
boke_boffa_TA by TA_2008
10 to 100
(2)
5 to 10
(1)
1 to 5
(1)
0,1 to 1
(1)
0 to 0,1 (13)
Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab.
pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.
Un exemple de changement d’échelle :
Focus sous-préfectoral
Pref. de Boke et Boffa
2007
2005
N
Geographic pattern of cholera
(sub-prefectoral scale)
Boke and Boffa
Dabiss
Sansalé
Dabiss
Sansalé
Sangarédi
Sangarédi
Tanéné (B)
Tanéné (B)
Boké-Centre
Kanfarandé
Kanfarandé
Kolaboui
Boké-Centre
Kolaboui
Malapouyah
Kam sar
Malapouyah
Kam sar
Bintim odia
Colia
Mankountan
Bintim odia
Colia
Mankountan
Lisso
Lisso
Tougnifili
Tougnifili
Douprou
Douprou
Boffa-Centre
Orientations opérationnelles
(Fieldwork support)
Boffa-Centre
Koba (B)
2006
Aide à la définition
de zone d’intervention
(a support to define intervention zones)
Koba (B)
2008
Dabiss
Sansalé
Dabiss
Sansalé
Sangarédi
Implantation
d’un système « sentinelle»
(set up « sentinelle » system)
10 to 100
5 to 10
1 to 5
0,1 to 1
0 to 0,1
(4)
(2)
(2)
(1)
(9)
Kanfarandé
Tanéné (B)
Boké-Centre
Kanfarandé
Kolaboui
Malapouyah
Kam sar
Boké-Centre
Kolaboui
Bintim odia
Malapouyah
Kam sar
Colia
Mankountan
Bintim odia
Colia
Mankountan
boke_boffa_TA by TA_2006
Lisso
Tougnifili
0,1 to 1
(1)
0 to 0,1 (17)
Sangarédi
Tanéné (B)
boke_boffa_TA by TA_2005
Lisso
Tougnifili
Douprou
Douprou
Boffa-Centre
Boffa-Centre
60 km
boke_boffa_TA by TA_2007
10 to 100
5 to 10
1 to 5
0,1 to 1
0 to 0,1
(2)
(2)
(6)
(2)
(6)
Koba (B)
Koba (B)
boke_boffa_TA by TA_2008
10 to 100
(2)
5 to 10
(1)
1 to 5
(1)
0,1 to 1
(1)
0 to 0,1 (13)
Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab.
pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.
2. Quels usages ? Quelles précisions ? Quelles informations à visées opérationnelles ?
Versant recherche / Versant opérationnel
Trans-national
Epidémiologie MACRO (approche globale: écologie marine, climat, … )
Epidemiology MACRO (Integrated and global approach, climat …)
/
Aide à la décision programme trans-nationaux
(Support / orientation of international programs)
National
Epidémiologie : étude de la diffusion et cartes thématiques
(Epidemiology : spread of outbreak, thematic maps)
Régional/préfectoral
/
Plan de contingence régionaux (contengency plan)
Epidémiologie MESO : facteurs environnementaux
(Epidemiology MESO : environmental factors)
Sous-préfectoral
(météorologie, biologie marine, prélvmts environnementaux, microbiologie, …)
/
Pré-positionnement , recherche des populations à risque,
« site sentinelle » sur la zone littorale
(Risk factors, target populations for prevention, early warning system : e.g. costal
points)
Zone urbaine
Epidémiologie MICRO en zone urbaine : dynamique de distribution des
cas, étude des facteurs de risques, recherche de cluster
(Epidemiology MICRO : urban settings , dynamic of outbreak, risk factors, cluster
identification)
Quartier
/ Prévention, orientation des activités de riposte (sensibilisation, CTC,
stocks, ….)(position of treatment center, register, follow-up, prevention …)
Taux d’incidence du choléra 2007 à Conakry (Guinée)
Analyses préliminaires (preliminary analyses)
Projet de préparation aux épidémies de choléra. Conakry, Guinée.
Commune de Ratoma
Hamdallaye 2
Hamdallaye 1
Hamdallaye Mosquée
Taouyah
Ratoma Dispensaire
Ratoma Centre
Dar Es Salam_r
Koloma 2
Koloma 1
Kipé
Kaporo Rails
Kaporo Centre
Nongo
Simbaya Gare
Sangoyah Mosquée
Wanindara
Lambandji
Kobaya
Sonfonia Centre
Sonfonia Gare
Yattayah
Commune de Matoto
Dabondy 1
Dabondy Rails
Dabondy 3
Dabondy 2
Gbessia Port 2
Gbessia Port 1
Gbessia Centre
Gbessia Cité 1
Dabondy Ecole
Gbessia Cité 3
Dar Es Salam_m
Gbessia Ecole
Gbessia Cité 2
Gbessia Cité de l'Air
Béhanzin
Tanéné Marché
Tanéné Mosquée
Camp Alpha Yaya Diallo
Yimbaya Permanence
Yimbaya Ecole
Yimbaya Tannerie
Simbaya 2
Simbaya 1
Matoto Centre
Matoto Khabitaya
Matoto Marché
Sangoyah Centre
Kissosso
Tombolia
Dabompa
54
53
42
55
56
57
60
59
76
58
77
78
79
80
88
89
90
91
97
96
92
45
52
49
50
67
66
65
63
51
62
61
68
64
69
70
71
72
75
74
73
82
83
81
85
86
84
87
93
94
95
Conakry - Rep. de Guinée. Année : 2007.
80
60
40
20
0,1
0
to
to
to
to
to
to
140
(4)
80
(4)
60
(3)
40 (12)
20 (70)
0,1 (4)
97
96
92
95
(ECHO, UNICEF, A CF-E, DPLM, ONRG, Université de Franche Comté)
Commune de Kaloum
Boulbinet
1
Manquepas
2
Sandervalia
3
kouléwondy
4
Almamya
5
Téminétaye
6
Sans Fil
7
Coronthie
8
Tombo
9
Commune de Matam
Lansébounyi
10
Coléah Domino
12
Coléah Centre
15
Coléah Imprimerie 16
Coléah Cité
14
Mafanco Centre
17
Mafanco
19
Madina Centre
18
Madina Cité
20
Madina Ecole
23
Boussoura
25
Madina Mosquée 24
Madina Marché
22
Touguiwondiy
36
Matam Lido
35
Matam
37
Bonfi
48
Bonfi Marché
47
Carrière
38
Hermakono
46
Commune de Dixinn
Cameroun
11
Camayenne
13
Landréah
21
Dixinn Port
28
Dixinn Mosquée
27
Dixinn Centre 2
30
Dixinn Rails
26
Dixinn Gare
31
Belle Vue Ecole
32
Dixinn Centre 1
29
Kénien
34
Hafia Mosquée
39
Hafia 2
43
Belle Vue Marché 33
Hafia 1
40
Minière
41
Hafia Minière
44
Taux d'incidence du choléra pour 10 000 hab.
94
91
90
89
88
93
87
79
80
85
86
84
78
58
81
77
82
55
42
13
12
11
76
60
54
53
75 74
72
59
57
56
83
69
61
62
52 51 63
43 44
41
50
45
49
40
46
39
33
38 47
34
48
32
37
29
35
28
30
31
36
27
25
23 26 24
21
20
22
14 17 19 18
15 16
68
64
70
73
67
71
65
66
10
9
8
5
4
1
2
3
7
6
UMR CNRS 6249
0
2
kilometres
4
Div. Prévention et
Lutte contre la
Maladie
Ministère de la Santé
et de l’Hygiène
Publique
République de Guinée
Taux d'incidence du choléra pour 10 000 hab.
Conakry - Rep. de Guinée. Année : 2007.
80
60
40
20
0,1
0
to
to
to
to
to
to
140
(4)
80
(4)
60
(3)
40 (12)
20 (70)
0,1 (4)
Recherche de cluster /modélisation
97
96
Ratio des cas de choléra observés/attendus
Cluster principal et clusters secondaires
3
1,5
1
0,5
0,25
0
92
(ECHO, UNICEF, A CF-E, DPLM, ONRG, Université de Franche Comté)
95
94
91
to
to
to
to
to
to
7
(8)
3
(7)
1,5
(8)
1
(21)
0,5 (34)
0,25 (19)
97
90
95
88
89
93
91
87
79
80
86
85
81
77
56
41
76
60
54
53
42
43 44
40
12
11
69
61
79
67
71
70
S 23
65
68
64
62
52 51 63
50
45
49
46
87
66
29
27
10
8
5
7
6
4
2
80
85
3
0
2
4
kilometres
S 29
81
13 aout - 2 septembre
58
77
57
76
60
54
-
55
42
75
59
56
53
52 51
61
69
68
65
62 64
63
83
82
74
73
72
71
70
41
43 44
66
50
45
49
40
46
33
39 38
48
32
34
37 47
28 29
35
27 30 31
36
13-23 octobre
23 24 25
21
20
22
13 14 16 19
18
15 17
12
11-30 septembre
11
Enquête terrain
Ménages (households)/
Quartiers
/cartographie thématique
86
84
78
9
1
93
83
21
13
88
73
39 38
33
47 48
34
32
37
35
30 31
36
25
23 26 24
20
22
14 17 19 18
15 16
28
89
82
75 74
72
59
57
55
90
(ECHO, UNICEF, A CF-E, ONRG, Université de Franche Comté)
58
94
3 sept - 23 septembre
84
78
96
92
67
12-29 septembre
10
9
8
5
1
2
4
3
6
7
0
2
kilometres
S 35
Complémentarité
(Various strategies of anayses)
Indice environnement sanitaire des quartiers
Enquête ACF-E (2010)
7,1
6,02
5,49
4,36
0
to
to
to
to
to
9,98
7,1
6,02
5,49
4,36
(21)
(17)
(20)
(18)
(21)
Choix raisonné des sites d’interventions
97
96
Scientific-based choices
Synthesis based on published littérature and results
(Conakry : Vibrio cholerae O1, poissons + (Boiro, 2005))
92
95
94
91
90
89
88
93
87
79
80
85
86
84
78
(ECHO, A CF-E, ONRG, Université de Franche Comté)
58
81
77
82
42
41
32
29
33
43 44
40
34
76
60
54
53
75 74
72
59
57
56
55
52
45
46
83
69
61
62
51 50 63
68
64
70
Orientations opérationnelles
73
67
71
65
66
49
39 38
47 48
37
35
30 31
36
25
23 26 24
20
22
14 17 19 18
15 16
28
27
21
13
11
12
10
9
8
5
1
2
4
3
7
6
0
2
kilometres
4
Modélisation du risque à partir
des caractéristiques des unités spatiales
(work orientation: harbour, coastal areas)
Lieux spécifiques pour la préparation et la prévention
• Débarcadères/Ports
• Zones de bras de mer et maraîchages
•…
4
3. Quelles méthodologies pour la confection de cartes ? Quels outils ?
•
I/Recueil des fonds de carte
(SIG layer for map )
–
–
Sous format papier
Mutualiser les compétences nationales en Guinée (Observatoire National de la Guinée)
(to combine national competences /experiences)
•
II/ Recueil des données de santé
(record of health data)
–
•
Partenariat avec les autorités sanitaires
(Partnership with MoH)
III/ Etude des facteurs de risques
(risk factor analyses)
• Synergie avec les ONG : Enquêtes sur le typologie des quartiers à Conakry par Action Contre La Faim
(partnership with non gouvernemental org.)
• Données environnementales ( pluviométrie, réseau hydrographique, réseau d’adduction eau …)
(environmental data, precipitation, hydrographic network)
• Etude cas-témoin ciblée sur le début des épidemies à Conakry
4. Quelles contraintes pour la faisabilité ?
•
Profondeur temporelle : comprendre l’épidémiologie et valider la modélisation
800
500
450
700
400
600
350
500
300
400
250
Conakry
(pluviométrie/cas)
200
300
150
200
100
100
2003
•
2006
0…
2005
Somme de précipitation
0…
2004
0…
0…
0
0…
50
0
2007
Somme de cas
Logiciel national pour la cartographie thématique déjà existant mais sous-utilisé
(need to supervise Ministery of Health agents in critical administrative positions)
– Healthmapper (WHO) : besoin d’accompagnement individuel à des postes-clé
– Mutualiser les compétences nationales (ONRG)
•
Cartographie analytique : ? coût des logiciels payants SIG (Mapinfo et Arc GIS), mais des
alternatives gratuites existent comme
(cost of software but free alternatives exist)
– QGIS (logiciel libre gratuit en Français) ou R pour les analyses
– Satscan (recherche de cluster)
– Favoriser la formation pour le développement des capacités au long terme
5. Recommandations
1/ Déterminer les quartiers à risque à Conakry (DPLM, ACF et UNICEF)
2/ Mutualiser les moyens et les compétences
(combine competences and supports)
3/ Etudier de l’hypothèse d’un réservoir environnemental /saisonnalité
• Institut National de Santé Publique, Centre halieutique de Boussoura, Institut Pasteur de
Kindia, DPLM, ….
4/ Favoriser l’utilisation de la cartographie au sein du système sanitaire => amélioration de la
surveillance épidémiologique
– Réaction plus précoce : seuil dans une zone géographique prédéfinie (par exemple Conakry)
(to shorten delay of reaction : define a threshold in a geographic zone)
5/ Cartographie/séries temporelles combinée pour les pays au regard du plateau continental guinéen
(Guinée-Bissau/Guinée/Sierra Leone et Liberia) => étude de la diffusion des épidémies
Koundara
Mali
Koubia
Gaoual
Lélouma
Tougué
Siguiri
Dinguiraye
Labé
Boké
Pita
Télimélé
Dalaba
Mandiana
Dabola
Mamou
Fria
Kouroussa
Boffa
Dubréka
Kankan
Kindia
Coyah
Faranah
Conakry
Forécariah
Kissidougou
Kerouané
Beyla
Geckedou
Macenta
Lola
N'Zerekoré
Yomou
Merci pour votre attention