Transcript 核酸等温扩增技术(一)
核酸等温扩增技术的定义及特点 核酸等温扩增技术是一类分子生物 学技术的总称,它们能在某一特定 的温度下扩增特定的DNA或者RNA。 与PCR技术相比核酸等温扩增对仪 器的要求大大简化,反应时间大大 缩短,更能满足快速简便的需求。 核酸等温扩增技术的分类 环介导等温扩增技术(LAMP) 依赖于核酸序列的扩增技术(NASBA) 滚环扩增技术(RCA) 单引物等温扩增技术(SPIA) 依赖于解旋酶的等温扩增技术(HAD) 链替代扩增技术(SDA) 快速等温检测放大技术(RIDA) 切刻内切酶核酸恒温扩增技术(NEMA) 环介导等温扩增技术(LAMP) 环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是2000年日本 研究人员Notomi等发明的一种新型体外等温 扩增特异性核酸片段的技术。 该技术主要利用两对特殊设计的引物和具有链 置换活性的DNA聚合酶,使反应中在模板两端 引物结合处循环出现环状单链结构,从而保证 引物可以在等温条件下顺利与模板结合,并进 行链置换扩增反应。 LAMP的特点 LAMP克服了传统PCR反应需要通过反复热变性获得单 链模板的缺点,避免了反复升降温的过程,实现了恒 温条件下的连续快速扩增,具有更高的灵敏度和扩增 效率。 15-60min内可扩增出109-1010倍靶序列拷贝,得到 500ug/ml的目的DNA。具有简单、快速、特异性强的 特点。 LAMP技术的原理 LAMP主要是利用4种不同的特异性引物识 别靶基因的6个特定区域,在等温条件进行 扩增反应。基因的扩增和产物的检测可一步 完成,所有靶基因序列的检测可只通过扩增 产物的有、无来判别。有、无扩增反应是利 用荧光定量PCR仪检测反应的荧光强度或利 用核酸扩增过程中产生的焦磷酸镁沉淀反应 用浊度仪检测沉淀浊度来判定。 LAMP引物设计 主要是针对靶基因的六个不同的区域,基于靶基因3’ 端的F3c、F2c和Flc区以及5’ 端的Bl、B2和B3区等6个不 同的位点设计4种引物。 FIP(Forward Inner Primer):上游内部引物,由F2区和 F1C区域组成,F2区与靶基因3’端的F2c区域互补,F1C 区与靶基因5’端的Flc区域序列相同。 F3引物:上游外部引物(Forward Outer Primer),由F3 区组成,并与靶基因的F3c区域互补。 BIP引物:下游内部引物(Backward Inner Primer ),由 B1C和B2区域组成,B2区与靶基因3’端的B2c区域互补, B1C域与靶基因5’端的Blc区域序列相同。 B3引物:下游外部引物(Backward Outer Primer ),由 B3区域组成,和靶基因的B3c区域互补。