Transcript Présentation au GREZOSP - Faculté de médecine vétérinaire

Ann Letellier, directrice (FMV)
Yvan L’Homme, co-directeur (ACIA)
• Groupe actif à l’UdeM depuis 2007
– Sous la direction de Dr Sylvain Quessy
• En 2009, suite à la reconnaissance officielle
par l’UdeM, nomination des membres de la
direction:
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Directrice (A Letellier, UMtl)
Co-directeur (Y L’Homme,ACIA)
Mandat de 2 ans
Supporté par un comité de gestion
• 25 membres à ce jour, diverses organisations
Enseignement*
Industrie
• CTIA: certificat en technologie et
innocuité des aliments (1er cycle)
Recherche
• Objectifs
– Optimiser les efforts de recherche et d’enseignement en
salubrité alimentaire dans l’Est du Canada
– Développer des stratégies d’analyse du risque
(évaluation, gestion et communication du risque) dans
une approche de la ferme à la table
– Développer des programmes d’enseignement
spécifiques visant une compréhension globale des
sources de contamination et le développement des
stratégies de contrôle
– Accroître les collaborations, le réseautage et les
échanges entre les chercheurs
– Optimiser la diffusion des résultats de la recherche et
leur impact
• L’adhésion comme membre du groupe:
– Chercheurs et microbiologistes ayant des activités en
salubrité alimentaire
– Adhésion volontaire
– Collaboration entre les membres et participation aux
activitiés (évaluation des séminaires d’étudiants,
enseignement au Certificat en technologie et innocuité
des aliments, présentation des activités de recherche)
– Membres d’agences gouvernementales/laboratoires et
centres gouvernementaux ou universités
– Membres réguliers ou associés (relié au niveau
d’activités en salubrité alimentaire)
MEMBRES (24)
FVM: Faculté de médecine vétérinaire (12)
• Dre Marie Archambault, Dre Josée Harel, Dre Ann Letellier, Dr Serge Messier
• Dr Jérôme DelCastillo, Dr John M. Fairbrother, Dr Malcom Gains, Dr Sylvain Quessy
• Dre Martine Bouliane, Dr Daniel Perron*, Dr Philippe Fravalo, Dre Nadia Bergeron
LST/CFIA: Laboratoire de St-Hyacinthe de l’Agence Canadienne d’Inspection des
Aliments (2)
• Dr Yvan l’Homme**, Dre Carole Simard**
CRDA/AAC: Centre de Recherche et Développement sur les Aliments d’Agriculture et
Agro-alimentaire Canada à St-Hyacinthe (5)
• Dre Evelyne Guévremont, Dre Julie Brassard**, Dre Michèle Marcotte
• Dr Alain Houde**, Dr Akier Assanta Mafu
IRDA: Institut de Recherche et de Développement en Agroenvironnement (2)
• Dre Caroline Côté**, Mme Mylène Généreux
HC: Laboratoire de Longueuil de Santé Canada (1)
•
M Yvon-Louis Trottier
PHAC: Agence de santé publique du Canada (2)
• Dre Rebecca Guy**
• Dr Pascal Michel**
MAPAQ: Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec (1)
• Dre Madeleine Fortin
* Professeurs invités au Département de pathologie et microbiologie
** Professeurs associés au Département de pathologie et microbiologie
« Chaire de recherche industrielle du CRSNG en
salubrité des viandes
(CRSV-CRSNG) »
Programme Professeurs-chercheurs industriels (PCI)
Demande de subvention No: 130565330
Faculté de médecine vétérinaire,
Université de Montréal.
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Ann Letellier, Ph.D., titulaire, professeure agrégée
Sylvain Quessy, DMV, Ph.D. vice-doyen recherche/étud.sup, professeur titulaire
Philippe Fravalo, Ph.D., professeur agrégé
Sylvette L-Lewandowski, Ph.D., professionnelle de recherche
Nadia Bergeron, DMV, PhD, professionnelle de recherche
L’équipe de la Chaire-CRSNG
•
Chercheurs associés
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–
–
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•
•
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•
Marie Archambault (antibiorésistance)
Martine Boulianne (Chaire avicole)
Jérôme del Castillo (pharmacologie)
Plusieurs collaborateurs de la FMV
(CRIP/GREMIP) et de l’extérieur
3 assistantes administratives
2 agents de recherche/technicien
Plus de 14 PhD et MSc, 2 postdoctorants
Laboratoire de diagnostic
– Bactériologie
– Épidémiologie moléculaire
– Détection d’antibiotiques dans les
aliments
•
Plusieurs experts dans le projet de
développement de la qualité
/salubrité des produits alimentaires
au Vietnam (5 MSc)
Les partenaires de la Chaire-CRSNG
• Chaire de recherche industrielle du CRSNG
en salubrité des viandes(2011-2016)
• 5 nouveaux partenaires industriels
• 2.2 Millions $ pour 5 ans
Nos partenaires
Salubrité des viandes
(B,C)
Pathogènes émergents
Développement de
stratégies de contrôle
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Mission de la Chaire
• Effectuer des recherches fondamentales et
appliquées en salubrité des viandes
• Supporter l’industrie dans les enjeux reliés à la
salubrité des viandes afin de maintenir la
confiance des consommateurs dans les produits
de viandes canadiens
• Développer des outils pour permettre à
l’industrie de demeurer compétitive face aux
agents pathogènes émergents
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Démarche basée sur l’analyse du
risque
• Évaluation du risque
– Identification et caractérisation des pathogènes émergents
– Étude de l’exposition, évaluation du risque réel pour l’humain
• Gestion du risque
– Stratégies de contrôle des agents pathogènes
– HACCP (analyse des risques et maîtrise des points critiques)
• Communication du risque
– Service d’accompagnement (autorités gouvernementales,
vétérinaires, industrie…)
– Réponse aux médias
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Vision commune-objectifs
complémentaires
Salubrité des viandes
(B,C)
Pathogènes émergents
Développement de
stratégies de contrôle
Utilisation
judicieuse des
médicaments
chez le porc
Volet 1
1 PhD
1 MSc
Épidémiologie et
contrôle des
pathogènes chez
le porc
Volet 2
1 PhD
2 Post-doc
2 MSc
Campylobacter
chez le poulet
de chair
Volet 3
2 PhD
2 MSc
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Certains autres projets…
• Grappes scientifiques porcines AAC (2011-2013)
– Développement de nouvelles stratégies alimentaires dans le
but d’améliorer le développement de l’intestin, les fonctions
de défense du système immunitaire, la santé et les
performances de croissance des porcelets
• Collaboration avec Dr Martin Lessard (AAC, Lennoxville)
• Modèle d’infection expérimentale à Salmonella Typhimurium
– Utilisation d’outils moléculaires, de géomatique et
d’analyse systémique pour identifier les principaux
vecteurs de contamination bactérienne et virale dans
un réseau abattoir-fermes porcines
• Collaboration avec U de Sherbrooke, AAC, ACIA
• 3 étudiants MSc, 1 étudiante PhD
Sujets de recherches complémentaires à
ceux de la CRSV- Dr Philippe Fravalo
• Listeria monocytogenes en production porcine:
– Abattage /découpe : détection et traçabilité moléculaire
(sérotypage par PCR et pulsotypage) en usine, adhérence aux
surfaces (PCR-SSCP)
– Tranchage du produit prêt à manger : évaluation de l’eau ozonée
comme moyen de gestion du risque
• Écologie de la flore digestive des porcs et volailles en
relation avec des évolutions de la diète (forme (mash/moulée)
et additifs alternatifs aux ATB) dans une perspective de
contrôle de Salmonella et Campylobacter
Évolution des dénombrements «pasteuriens » vers une approche
moléculaire : Q-PCR
Développement de typage de pathogènes (analyses HRM)
Analyse comparative d’empreintes de profils de flore (PCR-SSCP)
Analyse taxonomique par pyroséquençage (collaboration en cours)
Dr Yvon-Louis Trottier
Santé Canada
Laboratoire Régional de Microbiologie (Longueuil)
Expertise:
•Développement et évaluation de méthodes de détection et de confirmation de pathogènes
alimentaires pour application réglementaire ( Loi des aliments et drogues / Compendium
des méthodes d’analyses de santé Canada)
•Support aux activités de recherche du Bureau des dangers microbiens sur les méthodes
de détection et de caractérisation des pathogènes émergents ( Cronobacter (Enterobacter)
sakazakii, Arcobacter butzleri )
•Services d’analyses d’échantillons d’eau potable et environnementaux pour la santé des
premières nations au Québec (26 communautés)
•Collaboration au niveau national et international sur les comités de standardisation et de
validation de méthodes et l’incertitude de mesure en microbiologie. (ISO, AOAC)
•Activités d’analyse de conformité pour le programme de l’inspectorat de Santé Canada
(Pharmaceutique (USP), vérification de stérilité ,instruments médicaux, produits de santé
naturels, contrefaçon de médicaments, plaintes de consommateur, intégrité frontalière)
Projets en collaboration avec des membres du GRESA:
1.4500096 (2009-2012) - Caractérisation biologique, détection moléculaire et contrôle des virus d’origine alimentaire.
(Santé Canada (1) Trottier Y-L. (Longueuil) , (2) Houde. A., (3) Brassard, J. Agriculture et agroalimentaire Canada (StHyacinthe)
2.4500829 (2011-2012) - Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and bacterial
threats to humans in the food chain ( (1) Houde A., (2) Brassard J., (3) Guévremont E. , Agriculture et agroalimentaire
Canada (St-Hyacinthe) (4) Inglis D., Agriculture et agroalimentaire Canada (Lethbridge) , et (5) Tineke Jones Agriculture
et agroalimentaire Canada (Lacombe), Santé Canada Trottier Y-L. (Longueuil), .
Julie Brassard, PhD
CRDA, Virologie alimentaire
Domaines d'expertise :
•Détermination de l'origine des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain dans la chaîne
alimentaire et dans son environnement.
•Évaluation des profils de survie ou de persistance des virus pathogènes présentant des risques pour
l'humain dans la chaîne alimentaire et dans son environnement.
•Élaboration de stratégies de contrôle de la ferme à la table des virus pathogènes présentant des risques
pour l'humain.
•Étude des virus modèles ou substituts et des indicateurs viraux potentiels.
Projets en cours en collaboration avec des membres du GRESA:
1.2010-2013: Enhancing mitigation strategies for microbiological risk in fresh horticultural products. PI-Susan Bach AAC, Évelyne
Guévremont, Caroline Côté IRDA, Julie Brassard AAC.
2.2010-2013 - Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and bacterial threats to humans in
the food chain. PI- Évelyne Guévremont AAC, Yvon-Louis Trottier SC, Julie Brassard AAC, Alain Houde AAC, Yvan L’Homme, ACIA
3.2009-2012-Ecology of human enteric pathogens in fresh horticultural products. PI-Pascal Delaquis, AAC; Julie Brassard AAC,
Évelyne Guévremont AAC; Yvon-Louis-Trottier SC, Alain Houde AAC.
4.2010-2012- Use of tools related to molecular characterization, systemic analysis of stakeholders and geomatics for identification
of principal vectors and contamination sources by bacteria and virus indicators at farm and slaughterhouse level. PI- Ann Letellier
FMV; John Fairbrother FMV; Philippe Fravalo FMV, Yvan L’Homme ACIA, Julie Brassard AAC
5.2012-2013: Salubrité et impact technologique de la réduction en sodium suggérée par Santé Canada sur la fermentation et la
transformation des légumes (bactéries et virus pathogènes). PI -Tony Savard AAC, Julie Brassard AAC, Yvan L’Homme ACIA.
Dr Maf Akier Assanta
Expertise :
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Adhésion des bactéries pathogènes aux surfaces et formation des biofilms
Mise au point des stratégies de contrôle d'agents pathogènes et d'altération des
aliments
Microbiologie, salubrité des aliments, salubrité des surfaces et biosécurité
prévention de la contamination des aliments par la maîtrise de l'hygiène des
surfaces
Développement d'antimicrobiens naturels et résistance microbienne aux
désinfectants
Étude des paramètres physico-chimiques de la contamination des interfaces
Utilisation des probiotiques pour la biodécontamination des interfaces
Écologie microbienne des produits de viandes blanches (volaille) et rouges
Évaluation de l'hygiène des surfaces en bioindustrie et en milieu hospitalier par
les techniques moléculaires et microscopiques
Médecine vétérinaire (inspection de viandes et sous produits)
Activités internationales sur l’hygiène, la salubrité et la biosécurité des aliments
Projet de recherche avec les membres du GRESA
2011-2014 – Détection des résidus d’antibiotiques dans les œufs en coquille produits
dans les fermes de Kinshasa en République démocratique du Congo Héric Kazadi (1),
Faculté de médecine vétérinaire, Université de Kinshasa (Kinshasa); (2) Maf Akier
Assanta, Agriculture et Agroalimentaire Canada (St-Hyacinthe); (3) Martine Boulianne,
Faculté de médecine vétérinaire, Université de Montréal (St-Hyacinthe).
Dr Yvan L’Homme
Virologie
Intérêts de recherche
Détection, épidémiologie et contrôle de virus alimentaires
Taxonomie et classification virale
Caractérisation moléculaire, écologie et épidémiologie de virus entériques
Détection, épidémiologie et contrôle de la Paratuberculose
Détection, épidémiologie et contrôle des lentivirus des petits ruminants
Développement de méthodes diagnostiques alimentaires et vétérinaires
Projets en collaboration avec membres du GRESA
1. Caractérisation moléculaire, écologie et épidémiologie de virus entériques animaux et
humains (RotaV, AstroV, CaliciV, PicobirnaV, HEV) - Julie Brassard (AAC-GRESA)
2. Détection, épidémiologie et contrôle de virus alimentaires Julie Brassard (AAC-GRESA)
3. Étude des sources et vecteurs de contaminations virales dans un réseau abattoir-ferme
porcines Julie Brassard (AAC-GRESA), Ann Letellier (UdeM-GRESA), Philippe Fravalo (UdeM,
GRESA), John Fairbrother (UdeM, GRESA),
Hygiène de l’environnement agricole et salubrité des
produits horticoles
Caroline Côté, agr. Ph.D.
Expertise:
•Sources, survie et transport des microorganismes pathogènes pour l’humain
présents dans l’environnement agricole
• Salubrité de l’eau et des aliments
• Irrigation et épandage de fumiers
Projets en collaboration avec des membres du GRESA:
1. Impact de l’application de pesticides sur la persistance d’E. coli et de Salmonella spp. dans la culture du
brocoli (A. Letellier)
2. Impact de l’irrigation sur la salubrité de la laitue frisée et de l’oignon vert: combiner le délai irrigationrécolte et le contenu de l’eau en E . coli (J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)
3. Impact de l’épandage du lisier de porc et de la gestion de l’eau d’irrigation sur la salubrité du brocoli:
essai au champ (J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)
4. Impact de la date et de la source d’eau d’irrigation sur la salubrité de la laitue
(J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)
romaine en terre noire
Laboratoire de référence de l’OIE pour Escherichia coli
Faculté de médecine vétérinaire (FMV)
John M. Fairbrother, BVSc, PhD
Expertise
•Surveillance et diagnostic des E. coli
•Caractérisation et détection des E. coli pathogènes et résistance antimicrobienne
Projets de collaboration avec les membres du GRESA
1.2010-En cours. Effet de clinoptilolite sur les populations d’E. coli chez le porc. 1) Fairbrother JM,
FMV; 2) Letellier A, FMV; 3) Fravalo P, FMV.
2.2010-En cours. Caractérisation de souches d’E. coli isolées à partir d’échantillons d’eau, de fèces et
de carcasses de porcs et de poulets au Vietnam. 1) Fairbrother JM, FMV; 2) Letellier A, FMV; 3)
Quessy S, FMV.
3.2011-En cours. Prévalence de bactéries d’origine alimentaire et profils d’antibiorésistance dans des
carcasses de poulets vendus au détail au Vietnam. 1) Boulianne M, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3)
Quessy S, FMV.
4.2011-En cours. Effet des pratiques de biosécurité sur les populations bactériennes de poulailler avant
et après le détassement. 1) Boulianne M, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV.
5.2011-En cours. Impact de la moulée texturée sur les populations d’E. coli ainsi que la flore
commensale et le système digestif du porc. 1) Letellier A, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3) Fravalo
P, FMV.
6.2011-En cours. Analyse de la diffusion d’E. coli, marqueurs microbiologiques, dans un réseau
d’abattoirs et de fermes porcines. 1) Letellier A, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3) Brassard J,
Agriculture et agroalimentaire Canada (AAC); 4) Fravalo P, FMV; 5) L’Homme Y, ACIA.
7.2011. Impact de la date et de la source d’eau d’irrigation sur la salubrité de divers légumes et
végétaux. 1) Fairbrother JM, FMV; 2) Côté C, Institut de recherche et de développement en
agroenvironnement (IRDA).
Agence de la santé publique du Canada
Dre Rebecca Guy
Expertise:
•Développement des méthodes moléculaires rapides pour
quantification et caractérisations génétiques des protozoaires et
bactéries pathogènes, et quantification des pathogènes viables.
•Quantification et caractérisations génétiques des pathogènes
dans l’eau de sources d’eau potable et l’eau récréative.
•Caractérisations génétiques de Cryptosporidium , Giardia et
Campylobacter provenant de l’environnement, dans les animaux
et humains.
•La survie des pathogènes dans l'environnement.
Marie Archambault DMV, M.Sc., Ph.D., Dipl. ACVM
• Professeure agrégée, Faculté de Médecine vétérinaire, Université
de Montréal
Champs d’expertise:
– Résistance aux antibiotiques chez les bactéries
– Étude sur les mécanismes de résistance à la bacitracine et le biofilm
chez Clostridium perfringens
– Étude sur le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM)
en médecine vétérinaire
– Étude sur le transfert horizontal de la résistance aux antibiotiques chez
Enterococcus faecalis
– Diagnostic en bactériologie vétérinaire
Projet en collaboration:
1. Étude sur le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM)
chez le porc à l’abattoir au Québec (A Letellier)
2. Caractérisation des Enterococcus porcins et aviaires (A Letellier, J.
Harel)
Dr Evelyne Guévremont
Centre de recherche et de développement sur les aliments, St-Hyacinthe
Agriculture et Agroalimentaire Canada
Expertise
Travaux répondant à la priorité de recherche d’AAC de développer des
stratégies de gestion des risques microbiologiques dans la chaîne alimentaire:
•Ciblés en amont de la chaîne alimentaire soit en production laitière et horticole;
•Basés sur l’identification et la caractérisation de sources de Campylobacter
autres qu’aviaires;
•Isolement de Campylobacter jejuni/coli et émergents à partir d’échantillons de
fèces, lisier, eau et légumes feuillus, identification par PCR et comparaison des
souches par PFGE.
Projets en collaboration
1.Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and
bacterial threats to humans in the food chain. Collaborateurs: Julie Brassard
2.Enhancing mitigation strategies for microbiological risks in fresh horticultural products.
Collaborateurs: Julie Brassard, Caroline Côté
3.Co-directrice d’Alexandre Thibodeau, étudiant au docorat, Caractérisation des isolats de
Campylobacter jejuni aviaires. (A Letellier, P Fravalo, S Quessy)
Dr. Malcolm J Gains
pathologiste vétérinaire, FMV
Expertise
Nécropsie
Histologie
Immunohistochimie
Projets en collaboration
Étude des changements morphologiques dans l’intestin et les tissus
immunitaires associés aux divers régimes alimentaires chez le porc (A Letellier, P
Fravalo, S Quessy)
Pathogénie et contrôle des
infections à E. coli incluant O157:H7
Josée Harel (CRIP/GREMIP/GRESA) 2012
•
•
•
1,2
Influence du microbiote
Traite
intestinal sur la virulence de E.coli
0157
3Diagnostic et caractérisation
moléculaire et nanotechnologique
(Gènes de virulence et
antibiorésistance)
Lait
4Environnement
Fromages
– Interaction amibe /E. coli
– Régulation de l’expression
des gènes de virulence par
l’environnement
Transmission
Tube digestif
Bovin1
Récolte
Contamination
des carcasses
Viande
Transmission par
l’alimentation (66 %)3
directe (2 %)
Homme2
Contamination interhumaine
1,2Collaboration
INRA Clermont-Ferrand, 2G Le Bihan, 4M. Chekabab, 4R Lavoie, 3P Garneau
1,2 CRSNG stratégique, 2,4 CRSNG subvention à la découverte, 3 CSHB
Contamination
Fécale3
Fruits
Légumes
Eau (12 %)4
Dr Daniel Perron
• U de MTL : Professeur invité
– médecine réglementée et santé publique;
– ACIA - Université de Montréal - professeur invité : enseignement, formation
continue et perfectionnement, MSc et certificat, chaire de recherche en salubrité
des viandes (GRESA et GREMIP), centre de recherche aviaire, mentotat et
tutoriat;
– 4 universités canadiennes; Charlottetown, Calgary, Guelph et Saskatoon
(téléconférences, analyse du risque, MAE, réserve vétérinaire canadienne,
recrutement, échange étudiante, Association Canadienne Étudiante Médecine
Vétérinaire (ACEMV);
• ACIA : Vétérinaire Liaison
– ACIA / FMV / MAPAQ
• Activités académiques
– Coordonnateur adjoint du CTIA;
– Organiser des cours et des stages en MREG et santé publique avec les membres du GRESA;
– Participer à l’enseignement (MREG et santé publique) au niveau du 1ier cycle ainsi qu’à la
formation continue des professionnels des diverses organisations publiques;
• Co-directeur d’étudiants à la maîtrise professionnelle;
• Membre du jury pour les séminaires au GRESA;
Merci de votre attention!
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