תרגיל כיתה 8 כמצגת

Transcript תרגיל כיתה 8 כמצגת

Anti sense Sense (Gene)

א " נד ףצר םכינפל הז ףצרב היוצמה רתויב הכוראה האירקה תרגסמ תא אצמ .

א Anti sense ה לידג והמו לבקתמה ןובלחה ףצר תאו Sense ה לידג והמ ןייצ .

ב mRNA ה ףצר תא בותכ .

ג 5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG STOP CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT AT ATG CAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ ATG - CAG - AGA - TAA Met - Gln - Arg - stop

5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG STOP CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ DNA-SENSE 5 ’ ATG-TCG-GTG-AAT-TAT-TCA-GCA-GGG-TTG-TCG-CCT-TAC-GCG-GAT-ATT GGC-AAG-TGC-GGG-CTG-CCC-GAG-ATC-TTC-TAG 3 ’ mRNA 5 ’ AUG-UCG-GUG-AAU-UAU-UCA-GCA-GGG-UUG-UCG-CCU-UAC-GCG-GAU AUU- GGC-AAG-UGC-GGG-CUG-CCC-GAG-AUC-UUC-UAG 3 ’

mRNA 5 ’ AUG-UCG-GUG-AAU-UAU-UCA-GCA-GGG-UUG-UCG-CCU-UAC-GCG-GAU AUU- GGC-AAG-UGC-GGG-CUG-CCC-GAG-AUC-UUC-UAG 3 ’ PROTEIN N-

MSVNYSAGLSPYADKGKCGLPEIF

5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG

CCTGCTGA

TAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACT

ATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA

GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ ?

םאתהב : האבה היצטומה תובקעב ןובלחל הרקי המ A ו T ל וכפהי םינמוסמה T ו A םידיטואלקונ .

א TAA: STOP CODON ה רצווי

האירק תרגסמ לש העצמאב םתאש ןותנ םא 5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’

Wobble יקוח :Wobble יקוח תלבט

תויצטומל תינויצולובא םימאתומ , Wobble יקוח םגו , יטנגה דוקה : תועמשמ !

תוצופנ רתויה תויצטומה ןהש , transition

תויורשפא רפסמ שי םאה ?

ןיצואל וזיא אשונה tRNA

: הלאש

רובע עיצהל ןתינ ןודוקיטנא הזיא

יטנא םינודוק UA A UA G UA I UA U UA I UA G UA I םינודוק AUU AUA AUC G C A U I U or C G U A or G U,C or A

AUA

AUC

AUU

–

: הבושת

םה ןיצואלוזיא לש םינודוקה : םינודוקיטנא סינכהל לולע אוהש ךכ ,

AUA

AUC

, ןינויתמל ןודוק אוהש

AUU

דבלב

AUC ל

םתשולשל םיאתמ

AUG

ל םג לבא ) םימזינגרוא הברהב רידנ תיסחי אוה הז ןודוק יטנא ו

AUU

ל םיאתמ

AUU

ל םיאתמ –

AUA

ןכאו ל םיאתמ ( .

– – – –

UAA UAG UAI UAU

ןינויתמ םוקמב ןיצואלוזיא

תויורשפא רפסמ שי םאה ?

ןיצואל וזיא אשונה tRNA

: הלאש

רובע עיצהל ןתינ ןודוקיטנא הזיא

יטנא םינודוק UA A UA G UA I UA U UA I UA G UA I AUU AUA AUC םינודוק G C A I U U or C G U A or G U,C or A

AUA

AUC

AUU

–

: הבושת

םה ןיצואלוזיא לש םינודוקה : םינודוקיטנא סינכהל לולע אוהש ךכ ,

AUA

AUC

, ןינויתמל ןודוק אוהש

AUU

דבלב

AUC ל

םתשולשל םיאתמ

AUG

ל םג לבא ) םימזינגרוא הברהב רידנ תיסחי אוה הז ןודוק יטנא ו

AUU

ל םיאתמ

AUU

ל םיאתמ –

AUA

ןכאו ל םיאתמ ( .

– – – –

UAA UAG UAI UAU

ןינויתמ םוקמב ןיצואלוזיא

םיירלוקלומ םירקרמ תרזעב יופימ

יטנג יופימ עוציב תעב םיסוקולכ םישמשמ

םיירלוקלומ םירקרמ

•

Single nucleotide polymorphisms ( SNPs ) “snips” AACGTCATCG vs. AACGTTATCG Microsatellites - examined in lecture on a pedigree Simple sequence length polymorphisms ( SSLPs ) CGCGCG vs. CGCGCGCGCG vs. CGCG

The idea of Haplotypes

םוזומורכה הנבמו בכרה תא תטרפמה הפמל אמגוד

249 Mbp 4000+ genes

םיסיר לע יארחא " םיסיר " ןגה לש

יטננימודה ללאה , םירבכעב ךלש תלוכיב שומיש ךות ןגה תא תופמל ןיינועמ התא .

םימוח םיסיר לע יארחא םע

SNPs

לש הרדסל םיטוגיזורטהו

ללאהו , םירוחש .)

רבכע לכ רובע (

SNP

יפצר רפסמ , תינמז וב , חנעפל ל םיטוגיזורטה םירבכע ןיב האלכה לש םיצאצה ךינפל .

SNPs

םתוא לכל תויטוגיזומוהו םימוח םיסיר תולעב תובקנ

P: R/r SNP_A/SNP_a X r/r SNP_a/SNP_a םיסיר : Black Black Brown Brown SNP sequence seen: A/a 24% a/a 26% A/a 26% a/a 24% B/b 25% b/b 25% B/b 24% b/b 26% C/c 27% c/c 23% C/c 25% c/c 25% D/d 46% d/d 2% D/d 4% d/d 48% E/e 26% e/e 25% E/e 25% e/e 24% F/f 24% f/f 25% F/f 27% f/f 23% G/g 23% g/g 24% G/g 25% g/g 28% H/h 1% h/h 49% H/h 49% h/h 1% I/i 25% i/i 26% I/I 25% i/i 25% SNP Pair SNP is on Position of SNP

)

In million b.p.) Name chrom. #: A/a on Chromosome 1 194.7

B/b C/c D/d E/e F/f G/g H/h I/i 4 7 8 14 17 8 4 64.5

10.3

49.8

25.1

1 198.3

9.8

53.8

72.6

centiMorgan position of SNP on Chrom.

243 153 14 97 29 250 20 105 168 seq. of SNP variant “ x ” ..agcagctcca..

..gctcgtctta.. ..cacccttttc..

..attaacagca..

..ctcctgcttc..

..gatcaaccct..

..gggagcgtac..

..acagaaacag.

..gtcccccgag..

seq. of SNP variant “ X ” ..agcagTtcca..

..gAtcgtctta..

..cacTcttttc..

..attCacagca..

..ctcctgGttc..

..gatTaaccct..

..gggagcCtac..

..acTgaaacag..

..gtccTccgag..

" . םיסיר " ןגה אצמנ םוזומורכ הזיאב .

א 8 םוזומורכב

רבכעה לש

תיטנגה

הפמב " םיסיר " ןגה אצמנ ןכיה .

ב .

2 m.u

אוה .

6 m.u

אוה SNP-H ל SNP-H ל R ןגה ןיב קחרמה , ןכ לע , 2% אוה R ןגה ןיב קחרמה , ןכ לע , 6% אוה SNP-H ל R ןגה ןיב םייטנניבמוקרה םיאצאצה זוחא SNP-D ל R ןגה ןיב םייטנניבמוקרה םיאצאצה זוחא

SNP Pair SNP is on Name chrom. #: A/a B/b Position of SNP

)

In million b.p.) on Chromosome 1 194.7

4 64.5

C/c D/d E/e F/f G/g H/h I/i 7 8 14 17 8 4 10.3

49.8

25.1

1 198.3

9.8

53.8

72.6

centiMorgan position of SNP on Chrom.

243 153 14 97 29 250 20 105 168 103 seq. of SNP variant “ x ” ..agcagctcca..

..gctcgtctta.. ..cacccttttc..

..attaacagca..

..ctcctgcttc..

..gatcaaccct..

..gggagcgtac..

..acagaaacag.

..gtcccccgag..

105 SNP_D

RISIM

SNP_H

seq. of SNP variant “ X ” ..agcagTtcca..

..gAtcgtctta..

..cacTcttttc..

..attCacagca..

..ctcctgGttc..

..gatTaaccct..

..gggagcCtac..

..acTgaaacag..

..gtccTccgag..

קייודמ תעציבש יופימה המכ דע ?

רבכעה לש תיזיפה הפמב " םיסיר " ןגה אצמנ ןכיה .

ג 49.8

53.8

SNP_D

RISIM

SNP_H