Transcript Les rotavirus : autre virus de gastro

Les rotavirus : autre virus de
gastro-entérites chez l’Homme
• F : Reoviridae
– G : Rotavirus, Reovirus, Orbivirus
(bluetongue), Phytoréovirus (riz)
– Le genre Rotavirus comprend des virus
humains et animaux
– Chez l’homme, il provoque des gastro-entérites
– Agent étiologique majeur des diarrhées sévères
chez le jeune enfant : 30 à 50 % des
hospitalisations infantiles pour cause de DA
– 1000.000 décès / an dans monde (enfants)
Organisation et structure
• Virus non enveloppée ; capside icosahédrale
formée de 3 couches protéiques (1000 A° )
– très résistant dans l’environnement
• Génome ARN double brin segmenté (10 à
12 segments)
• Rotavirus humain : 11 segments = 12
protéines (6 structurales + 6 NS)
• système propre de réplication/transcription
Capside : structure et fonction
• Capside double couche ou monocouche non
infectieuses : les 3 couches sont nécessaires
• Couche externe : 260 trimères VP7 (gp 38
kD) + 120 copies VP4 (88 kD) spicules
dimériques
• 132 canaux ioniques traversent les 2
couchent externes
Capside : couche externe
• VP 4 : interaction avec la cellule hôte
– Attachement – pénétration –
hémagglutination – neutralisation et
virulence
• Clivage protéolytique de VP4 augmente son
infectiosité et son entrée (ex virus trypsiné)
Couche externe
• VP 4  VP8 (28 kD 247 aa) et VP5 (60 kD
aa 248-776) : restent associés dans le virion
• Fusion par VP4 à la cellule  clivage :
internalisation (?) mécanisme mal connu
Capside – VP4 très flexible
• Chez les rotavirus animaux, VP8 interagit
avec les acides sialiques mbr, VP5 avec les
intégrines
• Chez le rotavirus humain, VP5 induit
l’entrée du virus – sialic indépendant
entrée apicale ou baso-latérale des
entérocytes
• Si Sialic dépendant : induit une
conformation favorable à l’action de VP5
Capside – VP7 et DLP
• VP 7 rôle dans la décapsidation : influencé
par de faible [Ca] iC : dissocie VP7 trimers
=> décapsidation  libère les DLP active
• DLP : la transcription à lieu dedans
DLP
• Formée de VP6 (260 trimères - externe
interaction VP7/VP4) et de VP2 (interne)
• DLP nécessaire et suffisante pour transcrire
en ARNm – transcription endogène à DLP
DLP Transcription
• VP6 assure la structure de DLP pour y
assurer la transcription endogène (intra
DLP) et VP2 rôle dans la transcription
• Blocage de VP6 par Atc ou VP7 : courts
ARNm donc conformation stricte VP6-VP2
nécessaire pour des transcrits complets
Capside « interne » VP1 2 3
• VP2 la plus abondante (60 dimères) :
interaction avec VP6 et RNA génomique
– Auto-assemblage en ‘mini’ capside VP1
enzyme RNA pol RNA dép
• VP3 enzyme guanylyl méthyl transférase
Capside interne
• InteractionVP2/RNAg/VP1-3 : transcription
• mRNA 5’ Cap 3’consensus (pas de poly A)
• mRNA libérés par des canaux DLP
Organisation génomique
• 11 segments de 660 – 3300 bp
• Total 18.5 kbp
• Chaque segment a une interaction
symétrique avec VP2
génome
• Influence du pH dans la structure de
l’ARNg et son interaction avec VP2 : pH
élevé : affecte le complexe (déprotonation
de VP2)  condensation de l’ARN
isométrique (au centre de la particule)
Réplication et encapsidation
• Réplication concomitante avec la
transcription DANS la DLP
• Organisation en viroplasmes
• Comment la capside englobe le bon set de
segments ????
– Rôle des NSP
NSP 3
• NSP 3 protéine basique 63 kD, dimère :
domaine Nt interagit avec la séquence 3’
des ARNm
• Domaine Ct fixe eIF4G – traduction
• Protège l’ARNm
NSP 2 – NSP 5
• NSP2 et 5 impliquées dans la réplication et
l’encapsidation
• Présentes dans les viroplasmes
• NSP2 : NTPase, RNA-binding et hélicase
• Fournit l’énergie (hydrolyse NTP) pour
l’encapsidation
• NSP5 : protéine acide, interaction avec les
domaines basiques de NSP2 (?)
NSP
• NSP5 : rôle de régulation de l’interaction
NSP2/ARN pendant la réplication et
l’encapsidation
• NSP 4 , gp, aurait un rôle dans la régulation
de la [Ca2+] intra C : entérotoxine